Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.8■■■■□ 3.48
SEMA4DQ92854 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
SEMA4DQ92854 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC35.94■■■■□ 3.34
SEMA4DQ92854 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.86■■■■□ 3.33
SEMA4DQ92854 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
SEMA4DQ92854 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
SEMA4DQ92854 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
SEMA4DQ92854 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
SEMA4DQ92854 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SEMA4DQ92854 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
SEMA4DQ92854 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SEMA4DQ92854 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
SEMA4DQ92854 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
SEMA4DQ92854 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
SEMA4DQ92854 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
SEMA4DQ92854 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SEMA4DQ92854 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
SEMA4DQ92854 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
SEMA4DQ92854 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SEMA4DQ92854 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
SEMA4DQ92854 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
SEMA4DQ92854 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
SEMA4DQ92854 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.76■■■■□ 3
SEMA4DQ92854 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SEMA4DQ92854 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SEMA4DQ92854 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SEMA4DQ92854 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SEMA4DQ92854 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
SEMA4DQ92854 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
SEMA4DQ92854 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SEMA4DQ92854 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SEMA4DQ92854 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SEMA4DQ92854 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
SEMA4DQ92854 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SEMA4DQ92854 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
SEMA4DQ92854 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SEMA4DQ92854 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
SEMA4DQ92854 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
SEMA4DQ92854 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SEMA4DQ92854 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
SEMA4DQ92854 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
SEMA4DQ92854 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SEMA4DQ92854 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SEMA4DQ92854 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SEMA4DQ92854 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SEMA4DQ92854 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SEMA4DQ92854 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SEMA4DQ92854 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SEMA4DQ92854 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SEMA4DQ92854 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
SEMA4DQ92854 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
SEMA4DQ92854 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
SEMA4DQ92854 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
SEMA4DQ92854 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SEMA4DQ92854 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SEMA4DQ92854 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.16■■■□□ 2.74
SEMA4DQ92854 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SEMA4DQ92854 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SEMA4DQ92854 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SEMA4DQ92854 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
SEMA4DQ92854 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SEMA4DQ92854 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SEMA4DQ92854 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SEMA4DQ92854 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
SEMA4DQ92854 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
SEMA4DQ92854 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.93■■■□□ 2.7
SEMA4DQ92854 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.69
SEMA4DQ92854 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SEMA4DQ92854 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SEMA4DQ92854 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
SEMA4DQ92854 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
SEMA4DQ92854 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SEMA4DQ92854 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SEMA4DQ92854 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SEMA4DQ92854 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SEMA4DQ92854 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SEMA4DQ92854 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC31.68■■■□□ 2.66
SEMA4DQ92854 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SEMA4DQ92854 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
SEMA4DQ92854 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SEMA4DQ92854 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SEMA4DQ92854 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SEMA4DQ92854 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SEMA4DQ92854 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SEMA4DQ92854 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SEMA4DQ92854 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SEMA4DQ92854 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
SEMA4DQ92854 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SEMA4DQ92854 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SEMA4DQ92854 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SEMA4DQ92854 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
SEMA4DQ92854 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SEMA4DQ92854 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
SEMA4DQ92854 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
SEMA4DQ92854 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
SEMA4DQ92854 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SEMA4DQ92854 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SEMA4DQ92854 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SEMA4DQ92854 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SEMA4DQ92854 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.14■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms