Protein–RNA interactions for Protein: Q92673

SORL1, Sortilin-related receptor, humanhuman

Predictions only

Length 2,214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORL1Q92673 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SORL1Q92673 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SORL1Q92673 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SORL1Q92673 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SORL1Q92673 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SORL1Q92673 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SORL1Q92673 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SORL1Q92673 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SORL1Q92673 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SORL1Q92673 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SORL1Q92673 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SORL1Q92673 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SORL1Q92673 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SORL1Q92673 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SORL1Q92673 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SORL1Q92673 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SORL1Q92673 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SORL1Q92673 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SORL1Q92673 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SORL1Q92673 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SORL1Q92673 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SORL1Q92673 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SORL1Q92673 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SORL1Q92673 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SORL1Q92673 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SORL1Q92673 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SORL1Q92673 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SORL1Q92673 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SORL1Q92673 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SORL1Q92673 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SORL1Q92673 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SORL1Q92673 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SORL1Q92673 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SORL1Q92673 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
SORL1Q92673 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SORL1Q92673 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SORL1Q92673 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SORL1Q92673 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SORL1Q92673 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
SORL1Q92673 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SORL1Q92673 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SORL1Q92673 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SORL1Q92673 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SORL1Q92673 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SORL1Q92673 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SORL1Q92673 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SORL1Q92673 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
SORL1Q92673 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SORL1Q92673 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SORL1Q92673 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SORL1Q92673 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SORL1Q92673 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SORL1Q92673 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SORL1Q92673 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SORL1Q92673 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SORL1Q92673 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SORL1Q92673 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SORL1Q92673 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SORL1Q92673 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
SORL1Q92673 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SORL1Q92673 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SORL1Q92673 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
SORL1Q92673 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SORL1Q92673 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SORL1Q92673 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SORL1Q92673 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SORL1Q92673 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SORL1Q92673 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SORL1Q92673 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SORL1Q92673 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SORL1Q92673 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SORL1Q92673 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SORL1Q92673 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SORL1Q92673 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SORL1Q92673 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SORL1Q92673 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SORL1Q92673 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SORL1Q92673 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SORL1Q92673 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SORL1Q92673 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SORL1Q92673 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SORL1Q92673 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SORL1Q92673 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SORL1Q92673 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SORL1Q92673 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SORL1Q92673 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SORL1Q92673 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SORL1Q92673 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SORL1Q92673 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SORL1Q92673 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SORL1Q92673 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SORL1Q92673 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SORL1Q92673 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SORL1Q92673 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SORL1Q92673 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SORL1Q92673 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SORL1Q92673 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SORL1Q92673 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
SORL1Q92673 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SORL1Q92673 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms