Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD9

CASKIN1, Caskin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN1Q8WXD9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC54.68■■■■■ 6.34
CASKIN1Q8WXD9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC53.61■■■■■ 6.17
CASKIN1Q8WXD9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.24■■■■■ 6.11
CASKIN1Q8WXD9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.93■■■■■ 6.06
CASKIN1Q8WXD9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.9■■■■■ 6.06
CASKIN1Q8WXD9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.77■■■■■ 6.04
CASKIN1Q8WXD9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC52.71■■■■■ 6.03
CASKIN1Q8WXD9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC52.52■■■■■ 6
CASKIN1Q8WXD9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.31■■■■■ 5.8
CASKIN1Q8WXD9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC51.26■■■■■ 5.8
CASKIN1Q8WXD9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC51.25■■■■■ 5.79
CASKIN1Q8WXD9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC51.14■■■■■ 5.78
CASKIN1Q8WXD9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC51.14■■■■■ 5.78
CASKIN1Q8WXD9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC51.04■■■■■ 5.76
CASKIN1Q8WXD9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51.03■■■■■ 5.76
CASKIN1Q8WXD9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC50.67■■■■■ 5.7
CASKIN1Q8WXD9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC50.67■■■■■ 5.7
CASKIN1Q8WXD9 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.45■■■■■ 5.67
CASKIN1Q8WXD9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.37■■■■■ 5.65
CASKIN1Q8WXD9 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC50.34■■■■■ 5.65
CASKIN1Q8WXD9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC50.29■■■■■ 5.64
CASKIN1Q8WXD9 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.19■■■■■ 5.63
CASKIN1Q8WXD9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.18■■■■■ 5.62
CASKIN1Q8WXD9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.68■■■■■ 5.54
CASKIN1Q8WXD9 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.67■■■■■ 5.54
CASKIN1Q8WXD9 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC49.67■■■■■ 5.54
CASKIN1Q8WXD9 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.54■■■■■ 5.52
CASKIN1Q8WXD9 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC49.46■■■■■ 5.51
CASKIN1Q8WXD9 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC49.28■■■■■ 5.48
CASKIN1Q8WXD9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.25■■■■■ 5.47
CASKIN1Q8WXD9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC49.18■■■■■ 5.46
CASKIN1Q8WXD9 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.09■■■■■ 5.45
CASKIN1Q8WXD9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.89■■■■■ 5.42
CASKIN1Q8WXD9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.89■■■■■ 5.42
CASKIN1Q8WXD9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC48.85■■■■■ 5.41
CASKIN1Q8WXD9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC48.75■■■■■ 5.39
CASKIN1Q8WXD9 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48.74■■■■■ 5.39
CASKIN1Q8WXD9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC48.65■■■■■ 5.38
CASKIN1Q8WXD9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC48.65■■■■■ 5.38
CASKIN1Q8WXD9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC48.55■■■■■ 5.36
CASKIN1Q8WXD9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.55■■■■■ 5.36
CASKIN1Q8WXD9 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC48.45■■■■■ 5.35
CASKIN1Q8WXD9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.44■■■■■ 5.35
CASKIN1Q8WXD9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC48.39■■■■■ 5.34
CASKIN1Q8WXD9 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.36■■■■■ 5.33
CASKIN1Q8WXD9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.04■■■■■ 5.28
CASKIN1Q8WXD9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC47.85■■■■■ 5.25
CASKIN1Q8WXD9 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC47.82■■■■■ 5.25
CASKIN1Q8WXD9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC47.78■■■■■ 5.24
CASKIN1Q8WXD9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.73■■■■■ 5.23
CASKIN1Q8WXD9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.72■■■■■ 5.23
CASKIN1Q8WXD9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC47.6■■■■■ 5.21
CASKIN1Q8WXD9 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC47.51■■■■■ 5.2
CASKIN1Q8WXD9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC47.5■■■■■ 5.19
CASKIN1Q8WXD9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC47.47■■■■■ 5.19
CASKIN1Q8WXD9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC47.38■■■■■ 5.18
CASKIN1Q8WXD9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.38■■■■■ 5.18
CASKIN1Q8WXD9 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC47.31■■■■■ 5.16
CASKIN1Q8WXD9 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC47.3■■■■■ 5.16
CASKIN1Q8WXD9 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.27■■■■■ 5.16
CASKIN1Q8WXD9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.26■■■■■ 5.16
CASKIN1Q8WXD9 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.25■■■■■ 5.15
CASKIN1Q8WXD9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC47.23■■■■■ 5.15
CASKIN1Q8WXD9 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC47.21■■■■■ 5.15
CASKIN1Q8WXD9 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC47.18■■■■■ 5.14
CASKIN1Q8WXD9 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.08■■■■■ 5.13
CASKIN1Q8WXD9 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC47.08■■■■■ 5.13
CASKIN1Q8WXD9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC47.03■■■■■ 5.12
CASKIN1Q8WXD9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.98■■■■■ 5.11
CASKIN1Q8WXD9 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.97■■■■■ 5.11
CASKIN1Q8WXD9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC46.93■■■■■ 5.1
CASKIN1Q8WXD9 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.91■■■■■ 5.1
CASKIN1Q8WXD9 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC46.89■■■■■ 5.1
CASKIN1Q8WXD9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.89■■■■■ 5.1
CASKIN1Q8WXD9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.84■■■■■ 5.09
CASKIN1Q8WXD9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.84■■■■■ 5.09
CASKIN1Q8WXD9 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC46.82■■■■■ 5.09
CASKIN1Q8WXD9 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC46.82■■■■■ 5.09
CASKIN1Q8WXD9 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC46.78■■■■■ 5.08
CASKIN1Q8WXD9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC46.7■■■■■ 5.07
CASKIN1Q8WXD9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC46.7■■■■■ 5.07
CASKIN1Q8WXD9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC46.68■■■■■ 5.06
CASKIN1Q8WXD9 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.66■■■■■ 5.06
CASKIN1Q8WXD9 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.55■■■■■ 5.04
CASKIN1Q8WXD9 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.52■■■■■ 5.04
CASKIN1Q8WXD9 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC46.52■■■■■ 5.04
CASKIN1Q8WXD9 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC46.5■■■■■ 5.03
CASKIN1Q8WXD9 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.48■■■■■ 5.03
CASKIN1Q8WXD9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.48■■■■■ 5.03
CASKIN1Q8WXD9 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.47■■■■■ 5.03
CASKIN1Q8WXD9 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC46.44■■■■■ 5.02
CASKIN1Q8WXD9 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.43■■■■■ 5.02
CASKIN1Q8WXD9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.4■■■■■ 5.02
CASKIN1Q8WXD9 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.34■■■■■ 5.01
CASKIN1Q8WXD9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
CASKIN1Q8WXD9 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
CASKIN1Q8WXD9 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.3■■■■■ 5
CASKIN1Q8WXD9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
CASKIN1Q8WXD9 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.24■■■■■ 4.99
CASKIN1Q8WXD9 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC46.22■■■■■ 4.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms