Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWL7

CCNB3, G2/mitotic-specific cyclin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 1,395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNB3Q8WWL7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC53.49■■■■■ 6.15
CCNB3Q8WWL7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC52.62■■■■■ 6.01
CCNB3Q8WWL7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.07■■■■■ 5.93
CCNB3Q8WWL7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC51.8■■■■■ 5.88
CCNB3Q8WWL7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.73■■■■■ 5.87
CCNB3Q8WWL7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.54■■■■■ 5.84
CCNB3Q8WWL7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.53■■■■■ 5.84
CCNB3Q8WWL7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC51.23■■■■■ 5.79
CCNB3Q8WWL7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.41■■■■■ 5.66
CCNB3Q8WWL7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC50.18■■■■■ 5.62
CCNB3Q8WWL7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC50.17■■■■■ 5.62
CCNB3Q8WWL7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC50.11■■■■■ 5.61
CCNB3Q8WWL7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC50.02■■■■■ 5.6
CCNB3Q8WWL7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC50.01■■■■■ 5.6
CCNB3Q8WWL7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.89■■■■■ 5.58
CCNB3Q8WWL7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.72■■■■■ 5.55
CCNB3Q8WWL7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC49.62■■■■■ 5.53
CCNB3Q8WWL7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.61■■■■■ 5.53
CCNB3Q8WWL7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC49.59■■■■■ 5.53
CCNB3Q8WWL7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.29■■■■■ 5.48
CCNB3Q8WWL7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC49.12■■■■■ 5.45
CCNB3Q8WWL7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.05■■■■■ 5.44
CCNB3Q8WWL7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC49.04■■■■■ 5.44
CCNB3Q8WWL7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC48.94■■■■■ 5.43
CCNB3Q8WWL7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.9■■■■■ 5.42
CCNB3Q8WWL7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.81■■■■■ 5.4
CCNB3Q8WWL7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC48.81■■■■■ 5.4
CCNB3Q8WWL7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.64■■■■■ 5.38
CCNB3Q8WWL7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC48.64■■■■■ 5.38
CCNB3Q8WWL7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC48.41■■■■■ 5.34
CCNB3Q8WWL7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.41■■■■■ 5.34
CCNB3Q8WWL7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.15■■■■■ 5.3
CCNB3Q8WWL7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.12■■■■■ 5.29
CCNB3Q8WWL7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC48■■■■■ 5.27
CCNB3Q8WWL7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC47.82■■■■■ 5.25
CCNB3Q8WWL7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.79■■■■■ 5.24
CCNB3Q8WWL7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC47.74■■■■■ 5.23
CCNB3Q8WWL7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC47.72■■■■■ 5.23
CCNB3Q8WWL7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC47.69■■■■■ 5.22
CCNB3Q8WWL7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC47.65■■■■■ 5.22
CCNB3Q8WWL7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC47.6■■■■■ 5.21
CCNB3Q8WWL7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC47.59■■■■■ 5.21
CCNB3Q8WWL7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.35■■■■■ 5.17
CCNB3Q8WWL7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.33■■■■■ 5.17
CCNB3Q8WWL7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC47.28■■■■■ 5.16
CCNB3Q8WWL7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC47.14■■■■■ 5.14
CCNB3Q8WWL7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.12■■■■■ 5.13
CCNB3Q8WWL7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC47.09■■■■■ 5.13
CCNB3Q8WWL7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.05■■■■■ 5.12
CCNB3Q8WWL7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC46.97■■■■■ 5.11
CCNB3Q8WWL7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC46.94■■■■■ 5.11
CCNB3Q8WWL7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC46.88■■■■■ 5.1
CCNB3Q8WWL7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC46.63■■■■■ 5.06
CCNB3Q8WWL7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.63■■■■■ 5.06
CCNB3Q8WWL7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC46.56■■■■■ 5.04
CCNB3Q8WWL7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.56■■■■■ 5.04
CCNB3Q8WWL7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC46.53■■■■■ 5.04
CCNB3Q8WWL7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.5■■■■■ 5.03
CCNB3Q8WWL7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC46.43■■■■■ 5.02
CCNB3Q8WWL7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC46.4■■■■■ 5.02
CCNB3Q8WWL7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC46.36■■■■■ 5.01
CCNB3Q8WWL7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC46.32■■■■■ 5.01
CCNB3Q8WWL7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
CCNB3Q8WWL7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC46.28■■■■■ 5
CCNB3Q8WWL7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC46.25■■■■■ 4.99
CCNB3Q8WWL7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.24■■■■■ 4.99
CCNB3Q8WWL7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
CCNB3Q8WWL7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.17■■■■■ 4.98
CCNB3Q8WWL7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.98
CCNB3Q8WWL7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC46.11■■■■■ 4.97
CCNB3Q8WWL7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC46.09■■■■■ 4.97
CCNB3Q8WWL7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.07■■■■■ 4.97
CCNB3Q8WWL7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC46.06■■■■■ 4.96
CCNB3Q8WWL7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
CCNB3Q8WWL7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.06■■■■■ 4.96
CCNB3Q8WWL7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.05■■■■■ 4.96
CCNB3Q8WWL7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.02■■■■■ 4.96
CCNB3Q8WWL7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46■■■■■ 4.95
CCNB3Q8WWL7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.98■■■■■ 4.95
CCNB3Q8WWL7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC45.96■■■■■ 4.95
CCNB3Q8WWL7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC45.95■■■■■ 4.95
CCNB3Q8WWL7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC45.95■■■■■ 4.95
CCNB3Q8WWL7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.94■■■■■ 4.94
CCNB3Q8WWL7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC45.85■■■■■ 4.93
CCNB3Q8WWL7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC45.82■■■■■ 4.93
CCNB3Q8WWL7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
CCNB3Q8WWL7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.75■■■■■ 4.91
CCNB3Q8WWL7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.73■■■■■ 4.91
CCNB3Q8WWL7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.73■■■■■ 4.91
CCNB3Q8WWL7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC45.68■■■■■ 4.9
CCNB3Q8WWL7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
CCNB3Q8WWL7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC45.68■■■■■ 4.9
CCNB3Q8WWL7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.61■■■■■ 4.89
CCNB3Q8WWL7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC45.59■■■■■ 4.89
CCNB3Q8WWL7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC45.57■■■■■ 4.88
CCNB3Q8WWL7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.56■■■■■ 4.88
CCNB3Q8WWL7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
CCNB3Q8WWL7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.47■■■■■ 4.87
CCNB3Q8WWL7 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.37■■■■■ 4.85
CCNB3Q8WWL7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms