Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVN8

UBE2Q2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q2Q8WVN8 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC38.53■■■■□ 3.76
UBE2Q2Q8WVN8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
UBE2Q2Q8WVN8 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC38.19■■■■□ 3.7
UBE2Q2Q8WVN8 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
UBE2Q2Q8WVN8 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
UBE2Q2Q8WVN8 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
UBE2Q2Q8WVN8 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
UBE2Q2Q8WVN8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
UBE2Q2Q8WVN8 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
UBE2Q2Q8WVN8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
UBE2Q2Q8WVN8 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
UBE2Q2Q8WVN8 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
UBE2Q2Q8WVN8 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
UBE2Q2Q8WVN8 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
UBE2Q2Q8WVN8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.25
UBE2Q2Q8WVN8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC35.31■■■■□ 3.24
UBE2Q2Q8WVN8 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
UBE2Q2Q8WVN8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
UBE2Q2Q8WVN8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
UBE2Q2Q8WVN8 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.94■■■■□ 3.18
UBE2Q2Q8WVN8 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
UBE2Q2Q8WVN8 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
UBE2Q2Q8WVN8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
UBE2Q2Q8WVN8 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
UBE2Q2Q8WVN8 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
UBE2Q2Q8WVN8 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
UBE2Q2Q8WVN8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
UBE2Q2Q8WVN8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
UBE2Q2Q8WVN8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
UBE2Q2Q8WVN8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
UBE2Q2Q8WVN8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
UBE2Q2Q8WVN8 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
UBE2Q2Q8WVN8 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
UBE2Q2Q8WVN8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
UBE2Q2Q8WVN8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
UBE2Q2Q8WVN8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
UBE2Q2Q8WVN8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
UBE2Q2Q8WVN8 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
UBE2Q2Q8WVN8 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
UBE2Q2Q8WVN8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
UBE2Q2Q8WVN8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
UBE2Q2Q8WVN8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
UBE2Q2Q8WVN8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
UBE2Q2Q8WVN8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
UBE2Q2Q8WVN8 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
UBE2Q2Q8WVN8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
UBE2Q2Q8WVN8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
UBE2Q2Q8WVN8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
UBE2Q2Q8WVN8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
UBE2Q2Q8WVN8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
UBE2Q2Q8WVN8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
UBE2Q2Q8WVN8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
UBE2Q2Q8WVN8 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
UBE2Q2Q8WVN8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
UBE2Q2Q8WVN8 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
UBE2Q2Q8WVN8 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
UBE2Q2Q8WVN8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
UBE2Q2Q8WVN8 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
UBE2Q2Q8WVN8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
UBE2Q2Q8WVN8 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
UBE2Q2Q8WVN8 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
UBE2Q2Q8WVN8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
UBE2Q2Q8WVN8 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
UBE2Q2Q8WVN8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
UBE2Q2Q8WVN8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
UBE2Q2Q8WVN8 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
UBE2Q2Q8WVN8 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
UBE2Q2Q8WVN8 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
UBE2Q2Q8WVN8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
UBE2Q2Q8WVN8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
UBE2Q2Q8WVN8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
UBE2Q2Q8WVN8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
UBE2Q2Q8WVN8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
UBE2Q2Q8WVN8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
UBE2Q2Q8WVN8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
UBE2Q2Q8WVN8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
UBE2Q2Q8WVN8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
UBE2Q2Q8WVN8 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
UBE2Q2Q8WVN8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
UBE2Q2Q8WVN8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC32.8■■■□□ 2.84
UBE2Q2Q8WVN8 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
UBE2Q2Q8WVN8 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
UBE2Q2Q8WVN8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
UBE2Q2Q8WVN8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
UBE2Q2Q8WVN8 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
UBE2Q2Q8WVN8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
UBE2Q2Q8WVN8 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
UBE2Q2Q8WVN8 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
UBE2Q2Q8WVN8 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
UBE2Q2Q8WVN8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
UBE2Q2Q8WVN8 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
UBE2Q2Q8WVN8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
UBE2Q2Q8WVN8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
UBE2Q2Q8WVN8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
UBE2Q2Q8WVN8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
UBE2Q2Q8WVN8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
UBE2Q2Q8WVN8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
UBE2Q2Q8WVN8 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
UBE2Q2Q8WVN8 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
UBE2Q2Q8WVN8 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms