Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDV1

ST6GALNAC3, Alpha-N-acetylgalactosaminide alpha-2,6-sialyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ST6GALNAC3Q8NDV1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
ST6GALNAC3Q8NDV1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ST6GALNAC3Q8NDV1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
ST6GALNAC3Q8NDV1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
ST6GALNAC3Q8NDV1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ST6GALNAC3Q8NDV1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ST6GALNAC3Q8NDV1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
ST6GALNAC3Q8NDV1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ST6GALNAC3Q8NDV1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
ST6GALNAC3Q8NDV1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
ST6GALNAC3Q8NDV1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ST6GALNAC3Q8NDV1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ST6GALNAC3Q8NDV1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
ST6GALNAC3Q8NDV1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
ST6GALNAC3Q8NDV1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
ST6GALNAC3Q8NDV1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
ST6GALNAC3Q8NDV1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
ST6GALNAC3Q8NDV1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
ST6GALNAC3Q8NDV1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ST6GALNAC3Q8NDV1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ST6GALNAC3Q8NDV1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ST6GALNAC3Q8NDV1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ST6GALNAC3Q8NDV1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ST6GALNAC3Q8NDV1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ST6GALNAC3Q8NDV1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ST6GALNAC3Q8NDV1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ST6GALNAC3Q8NDV1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ST6GALNAC3Q8NDV1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ST6GALNAC3Q8NDV1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ST6GALNAC3Q8NDV1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ST6GALNAC3Q8NDV1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ST6GALNAC3Q8NDV1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ST6GALNAC3Q8NDV1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ST6GALNAC3Q8NDV1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ST6GALNAC3Q8NDV1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ST6GALNAC3Q8NDV1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ST6GALNAC3Q8NDV1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28■■■□□ 2.07
ST6GALNAC3Q8NDV1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ST6GALNAC3Q8NDV1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ST6GALNAC3Q8NDV1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ST6GALNAC3Q8NDV1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
ST6GALNAC3Q8NDV1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ST6GALNAC3Q8NDV1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ST6GALNAC3Q8NDV1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ST6GALNAC3Q8NDV1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ST6GALNAC3Q8NDV1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ST6GALNAC3Q8NDV1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ST6GALNAC3Q8NDV1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ST6GALNAC3Q8NDV1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ST6GALNAC3Q8NDV1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ST6GALNAC3Q8NDV1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ST6GALNAC3Q8NDV1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ST6GALNAC3Q8NDV1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ST6GALNAC3Q8NDV1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ST6GALNAC3Q8NDV1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ST6GALNAC3Q8NDV1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ST6GALNAC3Q8NDV1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ST6GALNAC3Q8NDV1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ST6GALNAC3Q8NDV1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ST6GALNAC3Q8NDV1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ST6GALNAC3Q8NDV1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ST6GALNAC3Q8NDV1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ST6GALNAC3Q8NDV1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ST6GALNAC3Q8NDV1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ST6GALNAC3Q8NDV1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ST6GALNAC3Q8NDV1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ST6GALNAC3Q8NDV1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ST6GALNAC3Q8NDV1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ST6GALNAC3Q8NDV1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ST6GALNAC3Q8NDV1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ST6GALNAC3Q8NDV1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ST6GALNAC3Q8NDV1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ST6GALNAC3Q8NDV1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ST6GALNAC3Q8NDV1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ST6GALNAC3Q8NDV1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ST6GALNAC3Q8NDV1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ST6GALNAC3Q8NDV1 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ST6GALNAC3Q8NDV1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ST6GALNAC3Q8NDV1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
ST6GALNAC3Q8NDV1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ST6GALNAC3Q8NDV1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ST6GALNAC3Q8NDV1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ST6GALNAC3Q8NDV1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ST6GALNAC3Q8NDV1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ST6GALNAC3Q8NDV1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ST6GALNAC3Q8NDV1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ST6GALNAC3Q8NDV1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ST6GALNAC3Q8NDV1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ST6GALNAC3Q8NDV1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ST6GALNAC3Q8NDV1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ST6GALNAC3Q8NDV1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ST6GALNAC3Q8NDV1 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ST6GALNAC3Q8NDV1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ST6GALNAC3Q8NDV1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ST6GALNAC3Q8NDV1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ST6GALNAC3Q8NDV1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ST6GALNAC3Q8NDV1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ST6GALNAC3Q8NDV1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ST6GALNAC3Q8NDV1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ST6GALNAC3Q8NDV1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms