Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5V2

NGEF, Ephexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGEFQ8N5V2 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC38.11■■■■□ 3.69
NGEFQ8N5V2 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
NGEFQ8N5V2 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
NGEFQ8N5V2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
NGEFQ8N5V2 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC37.99■■■■□ 3.67
NGEFQ8N5V2 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
NGEFQ8N5V2 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
NGEFQ8N5V2 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC37.95■■■■□ 3.67
NGEFQ8N5V2 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
NGEFQ8N5V2 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
NGEFQ8N5V2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC37.92■■■■□ 3.66
NGEFQ8N5V2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
NGEFQ8N5V2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
NGEFQ8N5V2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
NGEFQ8N5V2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC37.89■■■■□ 3.66
NGEFQ8N5V2 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
NGEFQ8N5V2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
NGEFQ8N5V2 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
NGEFQ8N5V2 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
NGEFQ8N5V2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
NGEFQ8N5V2 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
NGEFQ8N5V2 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
NGEFQ8N5V2 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
NGEFQ8N5V2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
NGEFQ8N5V2 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
NGEFQ8N5V2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
NGEFQ8N5V2 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
NGEFQ8N5V2 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC37.7■■■■□ 3.63
NGEFQ8N5V2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC37.68■■■■□ 3.62
NGEFQ8N5V2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
NGEFQ8N5V2 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
NGEFQ8N5V2 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
NGEFQ8N5V2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
NGEFQ8N5V2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC37.62■■■■□ 3.61
NGEFQ8N5V2 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
NGEFQ8N5V2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
NGEFQ8N5V2 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
NGEFQ8N5V2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
NGEFQ8N5V2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
NGEFQ8N5V2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
NGEFQ8N5V2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
NGEFQ8N5V2 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
NGEFQ8N5V2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
NGEFQ8N5V2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
NGEFQ8N5V2 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
NGEFQ8N5V2 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
NGEFQ8N5V2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
NGEFQ8N5V2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
NGEFQ8N5V2 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
NGEFQ8N5V2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
NGEFQ8N5V2 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
NGEFQ8N5V2 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
NGEFQ8N5V2 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
NGEFQ8N5V2 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC37.4■■■■□ 3.58
NGEFQ8N5V2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
NGEFQ8N5V2 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.58
NGEFQ8N5V2 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
NGEFQ8N5V2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
NGEFQ8N5V2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
NGEFQ8N5V2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
NGEFQ8N5V2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
NGEFQ8N5V2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
NGEFQ8N5V2 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
NGEFQ8N5V2 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
NGEFQ8N5V2 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
NGEFQ8N5V2 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
NGEFQ8N5V2 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
NGEFQ8N5V2 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
NGEFQ8N5V2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
NGEFQ8N5V2 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
NGEFQ8N5V2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
NGEFQ8N5V2 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
NGEFQ8N5V2 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
NGEFQ8N5V2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
NGEFQ8N5V2 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
NGEFQ8N5V2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
NGEFQ8N5V2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
NGEFQ8N5V2 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC37.04■■■■□ 3.52
NGEFQ8N5V2 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
NGEFQ8N5V2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
NGEFQ8N5V2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
NGEFQ8N5V2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.52
NGEFQ8N5V2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
NGEFQ8N5V2 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC37.01■■■■□ 3.51
NGEFQ8N5V2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
NGEFQ8N5V2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
NGEFQ8N5V2 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
NGEFQ8N5V2 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
NGEFQ8N5V2 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
NGEFQ8N5V2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC36.93■■■■□ 3.5
NGEFQ8N5V2 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC36.93■■■■□ 3.5
NGEFQ8N5V2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
NGEFQ8N5V2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
NGEFQ8N5V2 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
NGEFQ8N5V2 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
NGEFQ8N5V2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
NGEFQ8N5V2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
NGEFQ8N5V2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
NGEFQ8N5V2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.86■■■■□ 3.49
NGEFQ8N5V2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms