Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZQ1

WDFY3, WD repeat and FYVE domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,526 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDFY3Q8IZQ1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
WDFY3Q8IZQ1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.9■■■□□ 2.86
WDFY3Q8IZQ1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.87■■■□□ 2.85
WDFY3Q8IZQ1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
WDFY3Q8IZQ1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
WDFY3Q8IZQ1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
WDFY3Q8IZQ1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
WDFY3Q8IZQ1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
WDFY3Q8IZQ1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
WDFY3Q8IZQ1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.62■■■□□ 2.65
WDFY3Q8IZQ1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
WDFY3Q8IZQ1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.5■■■□□ 2.63
WDFY3Q8IZQ1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
WDFY3Q8IZQ1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
WDFY3Q8IZQ1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
WDFY3Q8IZQ1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
WDFY3Q8IZQ1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
WDFY3Q8IZQ1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
WDFY3Q8IZQ1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
WDFY3Q8IZQ1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
WDFY3Q8IZQ1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
WDFY3Q8IZQ1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
WDFY3Q8IZQ1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
WDFY3Q8IZQ1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
WDFY3Q8IZQ1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
WDFY3Q8IZQ1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
WDFY3Q8IZQ1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
WDFY3Q8IZQ1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
WDFY3Q8IZQ1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
WDFY3Q8IZQ1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
WDFY3Q8IZQ1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
WDFY3Q8IZQ1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
WDFY3Q8IZQ1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
WDFY3Q8IZQ1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
WDFY3Q8IZQ1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
WDFY3Q8IZQ1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
WDFY3Q8IZQ1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
WDFY3Q8IZQ1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
WDFY3Q8IZQ1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
WDFY3Q8IZQ1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
WDFY3Q8IZQ1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
WDFY3Q8IZQ1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
WDFY3Q8IZQ1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
WDFY3Q8IZQ1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
WDFY3Q8IZQ1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
WDFY3Q8IZQ1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
WDFY3Q8IZQ1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
WDFY3Q8IZQ1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
WDFY3Q8IZQ1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
WDFY3Q8IZQ1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
WDFY3Q8IZQ1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
WDFY3Q8IZQ1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
WDFY3Q8IZQ1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
WDFY3Q8IZQ1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
WDFY3Q8IZQ1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
WDFY3Q8IZQ1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
WDFY3Q8IZQ1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
WDFY3Q8IZQ1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
WDFY3Q8IZQ1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
WDFY3Q8IZQ1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
WDFY3Q8IZQ1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
WDFY3Q8IZQ1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
WDFY3Q8IZQ1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
WDFY3Q8IZQ1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
WDFY3Q8IZQ1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
WDFY3Q8IZQ1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
WDFY3Q8IZQ1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
WDFY3Q8IZQ1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
WDFY3Q8IZQ1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
WDFY3Q8IZQ1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
WDFY3Q8IZQ1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
WDFY3Q8IZQ1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
WDFY3Q8IZQ1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
WDFY3Q8IZQ1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
WDFY3Q8IZQ1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
WDFY3Q8IZQ1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
WDFY3Q8IZQ1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
WDFY3Q8IZQ1 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
WDFY3Q8IZQ1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
WDFY3Q8IZQ1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
WDFY3Q8IZQ1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
WDFY3Q8IZQ1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
WDFY3Q8IZQ1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
WDFY3Q8IZQ1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
WDFY3Q8IZQ1 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
WDFY3Q8IZQ1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
WDFY3Q8IZQ1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
WDFY3Q8IZQ1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
WDFY3Q8IZQ1 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
WDFY3Q8IZQ1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
WDFY3Q8IZQ1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
WDFY3Q8IZQ1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
WDFY3Q8IZQ1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
WDFY3Q8IZQ1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
WDFY3Q8IZQ1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
WDFY3Q8IZQ1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
WDFY3Q8IZQ1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
WDFY3Q8IZQ1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
WDFY3Q8IZQ1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
WDFY3Q8IZQ1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms