Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
SKAP1Q86WV1 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
SKAP1Q86WV1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
SKAP1Q86WV1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
SKAP1Q86WV1 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
SKAP1Q86WV1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
SKAP1Q86WV1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
SKAP1Q86WV1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
SKAP1Q86WV1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
SKAP1Q86WV1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
SKAP1Q86WV1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
SKAP1Q86WV1 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
SKAP1Q86WV1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
SKAP1Q86WV1 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
SKAP1Q86WV1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
SKAP1Q86WV1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
SKAP1Q86WV1 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
SKAP1Q86WV1 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
SKAP1Q86WV1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
SKAP1Q86WV1 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
SKAP1Q86WV1 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
SKAP1Q86WV1 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
SKAP1Q86WV1 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
SKAP1Q86WV1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC35.86■■■■□ 3.33
SKAP1Q86WV1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
SKAP1Q86WV1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
SKAP1Q86WV1 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
SKAP1Q86WV1 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SKAP1Q86WV1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
SKAP1Q86WV1 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
SKAP1Q86WV1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
SKAP1Q86WV1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
SKAP1Q86WV1 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
SKAP1Q86WV1 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
SKAP1Q86WV1 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
SKAP1Q86WV1 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
SKAP1Q86WV1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
SKAP1Q86WV1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.72■■■■□ 3.31
SKAP1Q86WV1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC35.71■■■■□ 3.31
SKAP1Q86WV1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
SKAP1Q86WV1 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
SKAP1Q86WV1 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
SKAP1Q86WV1 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
SKAP1Q86WV1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
SKAP1Q86WV1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
SKAP1Q86WV1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
SKAP1Q86WV1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
SKAP1Q86WV1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
SKAP1Q86WV1 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC35.58■■■■□ 3.29
SKAP1Q86WV1 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
SKAP1Q86WV1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
SKAP1Q86WV1 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC35.53■■■■□ 3.28
SKAP1Q86WV1 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
SKAP1Q86WV1 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
SKAP1Q86WV1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
SKAP1Q86WV1 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
SKAP1Q86WV1 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
SKAP1Q86WV1 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
SKAP1Q86WV1 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
SKAP1Q86WV1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC35.45■■■■□ 3.27
SKAP1Q86WV1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
SKAP1Q86WV1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
SKAP1Q86WV1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
SKAP1Q86WV1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
SKAP1Q86WV1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
SKAP1Q86WV1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.26
SKAP1Q86WV1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
SKAP1Q86WV1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
SKAP1Q86WV1 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
SKAP1Q86WV1 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SKAP1Q86WV1 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SKAP1Q86WV1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
SKAP1Q86WV1 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
SKAP1Q86WV1 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
SKAP1Q86WV1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SKAP1Q86WV1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
SKAP1Q86WV1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
SKAP1Q86WV1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.18■■■■□ 3.22
SKAP1Q86WV1 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
SKAP1Q86WV1 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC35.16■■■■□ 3.22
SKAP1Q86WV1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
SKAP1Q86WV1 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SKAP1Q86WV1 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
SKAP1Q86WV1 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC35.09■■■■□ 3.21
SKAP1Q86WV1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
SKAP1Q86WV1 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
SKAP1Q86WV1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
SKAP1Q86WV1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
SKAP1Q86WV1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
SKAP1Q86WV1 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC35.05■■■■□ 3.2
SKAP1Q86WV1 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
SKAP1Q86WV1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC35.03■■■■□ 3.2
SKAP1Q86WV1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
SKAP1Q86WV1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
SKAP1Q86WV1 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
SKAP1Q86WV1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
SKAP1Q86WV1 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
SKAP1Q86WV1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SKAP1Q86WV1 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
SKAP1Q86WV1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.92■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 613.7 ms