Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC47.3■■■■■ 5.16
NLRP13Q86W25 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC46.77■■■■■ 5.08
NLRP13Q86W25 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
NLRP13Q86W25 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.09■■■■■ 4.97
NLRP13Q86W25 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.71■■■■■ 4.91
NLRP13Q86W25 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.7■■■■■ 4.91
NLRP13Q86W25 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.46■■■■■ 4.87
NLRP13Q86W25 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC45.12■■■■■ 4.81
NLRP13Q86W25 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.8■■■■■ 4.76
NLRP13Q86W25 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC44.56■■■■■ 4.72
NLRP13Q86W25 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC44.53■■■■■ 4.72
NLRP13Q86W25 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC44.41■■■■■ 4.7
NLRP13Q86W25 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC44.36■■■■■ 4.69
NLRP13Q86W25 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.33■■■■■ 4.69
NLRP13Q86W25 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
NLRP13Q86W25 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC44.13■■■■■ 4.66
NLRP13Q86W25 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC44.1■■■■■ 4.65
NLRP13Q86W25 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.08■■■■■ 4.65
NLRP13Q86W25 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.04■■■■■ 4.64
NLRP13Q86W25 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
NLRP13Q86W25 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.88■■■■■ 4.62
NLRP13Q86W25 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC43.68■■■■■ 4.58
NLRP13Q86W25 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
NLRP13Q86W25 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
NLRP13Q86W25 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
NLRP13Q86W25 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.29■■■■■ 4.52
NLRP13Q86W25 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC43.26■■■■■ 4.52
NLRP13Q86W25 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.19■■■■■ 4.5
NLRP13Q86W25 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
NLRP13Q86W25 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
NLRP13Q86W25 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC43.03■■■■■ 4.48
NLRP13Q86W25 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
NLRP13Q86W25 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.81■■■■■ 4.44
NLRP13Q86W25 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC42.66■■■■■ 4.42
NLRP13Q86W25 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC42.57■■■■■ 4.41
NLRP13Q86W25 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC42.53■■■■■ 4.4
NLRP13Q86W25 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
NLRP13Q86W25 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC42.48■■■■■ 4.39
NLRP13Q86W25 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.45■■■■■ 4.39
NLRP13Q86W25 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC42.4■■■■■ 4.38
NLRP13Q86W25 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC42.32■■■■■ 4.37
NLRP13Q86W25 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.29■■■■■ 4.36
NLRP13Q86W25 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC42.19■■■■■ 4.34
NLRP13Q86W25 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC42.08■■■■■ 4.33
NLRP13Q86W25 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
NLRP13Q86W25 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
NLRP13Q86W25 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
NLRP13Q86W25 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
NLRP13Q86W25 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.92■■■■■ 4.3
NLRP13Q86W25 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
NLRP13Q86W25 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
NLRP13Q86W25 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
NLRP13Q86W25 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
NLRP13Q86W25 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
NLRP13Q86W25 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.58■■■■■ 4.25
NLRP13Q86W25 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC41.5■■■■■ 4.23
NLRP13Q86W25 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC41.46■■■■■ 4.23
NLRP13Q86W25 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.41■■■■■ 4.22
NLRP13Q86W25 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.38■■■■■ 4.21
NLRP13Q86W25 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
NLRP13Q86W25 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC41.27■■■■■ 4.2
NLRP13Q86W25 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.26■■■■■ 4.19
NLRP13Q86W25 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
NLRP13Q86W25 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC41.2■■■■■ 4.19
NLRP13Q86W25 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
NLRP13Q86W25 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.18■■■■■ 4.18
NLRP13Q86W25 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
NLRP13Q86W25 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
NLRP13Q86W25 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
NLRP13Q86W25 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
NLRP13Q86W25 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
NLRP13Q86W25 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
NLRP13Q86W25 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC41.02■■■■■ 4.16
NLRP13Q86W25 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC41.01■■■■■ 4.16
NLRP13Q86W25 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
NLRP13Q86W25 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.98■■■■■ 4.15
NLRP13Q86W25 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC40.9■■■■■ 4.14
NLRP13Q86W25 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
NLRP13Q86W25 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.87■■■■■ 4.13
NLRP13Q86W25 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC40.86■■■■■ 4.13
NLRP13Q86W25 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC40.8■■■■■ 4.12
NLRP13Q86W25 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
NLRP13Q86W25 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.74■■■■■ 4.11
NLRP13Q86W25 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.72■■■■■ 4.11
NLRP13Q86W25 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
NLRP13Q86W25 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
NLRP13Q86W25 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.7■■■■■ 4.11
NLRP13Q86W25 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
NLRP13Q86W25 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
NLRP13Q86W25 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC40.63■■■■■ 4.09
NLRP13Q86W25 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
NLRP13Q86W25 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
NLRP13Q86W25 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.61■■■■■ 4.09
NLRP13Q86W25 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
NLRP13Q86W25 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
NLRP13Q86W25 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC40.57■■■■■ 4.09
NLRP13Q86W25 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
NLRP13Q86W25 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
NLRP13Q86W25 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
NLRP13Q86W25 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.6 ms