Protein–RNA interactions for Protein: Q86UP9

LHFPL3, LHFPL tetraspan subfamily member 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHFPL3Q86UP9 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
LHFPL3Q86UP9 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
LHFPL3Q86UP9 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
LHFPL3Q86UP9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
LHFPL3Q86UP9 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LHFPL3Q86UP9 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LHFPL3Q86UP9 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
LHFPL3Q86UP9 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LHFPL3Q86UP9 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LHFPL3Q86UP9 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
LHFPL3Q86UP9 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LHFPL3Q86UP9 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LHFPL3Q86UP9 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LHFPL3Q86UP9 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
LHFPL3Q86UP9 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
LHFPL3Q86UP9 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
LHFPL3Q86UP9 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
LHFPL3Q86UP9 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
LHFPL3Q86UP9 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
LHFPL3Q86UP9 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
LHFPL3Q86UP9 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LHFPL3Q86UP9 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
LHFPL3Q86UP9 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
LHFPL3Q86UP9 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LHFPL3Q86UP9 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LHFPL3Q86UP9 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LHFPL3Q86UP9 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LHFPL3Q86UP9 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LHFPL3Q86UP9 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
LHFPL3Q86UP9 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
LHFPL3Q86UP9 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LHFPL3Q86UP9 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
LHFPL3Q86UP9 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LHFPL3Q86UP9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LHFPL3Q86UP9 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LHFPL3Q86UP9 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LHFPL3Q86UP9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LHFPL3Q86UP9 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LHFPL3Q86UP9 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LHFPL3Q86UP9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LHFPL3Q86UP9 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LHFPL3Q86UP9 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LHFPL3Q86UP9 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LHFPL3Q86UP9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LHFPL3Q86UP9 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LHFPL3Q86UP9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LHFPL3Q86UP9 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LHFPL3Q86UP9 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
LHFPL3Q86UP9 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
LHFPL3Q86UP9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LHFPL3Q86UP9 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
LHFPL3Q86UP9 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
LHFPL3Q86UP9 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
LHFPL3Q86UP9 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
LHFPL3Q86UP9 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
LHFPL3Q86UP9 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
LHFPL3Q86UP9 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LHFPL3Q86UP9 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
LHFPL3Q86UP9 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
LHFPL3Q86UP9 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
LHFPL3Q86UP9 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
LHFPL3Q86UP9 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
LHFPL3Q86UP9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
LHFPL3Q86UP9 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
LHFPL3Q86UP9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
LHFPL3Q86UP9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
LHFPL3Q86UP9 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
LHFPL3Q86UP9 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
LHFPL3Q86UP9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
LHFPL3Q86UP9 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
LHFPL3Q86UP9 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
LHFPL3Q86UP9 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
LHFPL3Q86UP9 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
LHFPL3Q86UP9 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
LHFPL3Q86UP9 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LHFPL3Q86UP9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
LHFPL3Q86UP9 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LHFPL3Q86UP9 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
LHFPL3Q86UP9 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LHFPL3Q86UP9 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LHFPL3Q86UP9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LHFPL3Q86UP9 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LHFPL3Q86UP9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LHFPL3Q86UP9 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LHFPL3Q86UP9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LHFPL3Q86UP9 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LHFPL3Q86UP9 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LHFPL3Q86UP9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LHFPL3Q86UP9 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LHFPL3Q86UP9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LHFPL3Q86UP9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LHFPL3Q86UP9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LHFPL3Q86UP9 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LHFPL3Q86UP9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LHFPL3Q86UP9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LHFPL3Q86UP9 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LHFPL3Q86UP9 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
LHFPL3Q86UP9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
LHFPL3Q86UP9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LHFPL3Q86UP9 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms