Protein–RNA interactions for Protein: Q76EJ3

SLC35D2, UDP-N-acetylglucosamine/UDP-glucose/GDP-mannose transporter, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35D2Q76EJ3 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
SLC35D2Q76EJ3 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
SLC35D2Q76EJ3 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
SLC35D2Q76EJ3 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SLC35D2Q76EJ3 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SLC35D2Q76EJ3 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SLC35D2Q76EJ3 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
SLC35D2Q76EJ3 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SLC35D2Q76EJ3 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SLC35D2Q76EJ3 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLC35D2Q76EJ3 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLC35D2Q76EJ3 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLC35D2Q76EJ3 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLC35D2Q76EJ3 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SLC35D2Q76EJ3 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SLC35D2Q76EJ3 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SLC35D2Q76EJ3 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SLC35D2Q76EJ3 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SLC35D2Q76EJ3 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SLC35D2Q76EJ3 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SLC35D2Q76EJ3 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SLC35D2Q76EJ3 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SLC35D2Q76EJ3 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
SLC35D2Q76EJ3 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SLC35D2Q76EJ3 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC35D2Q76EJ3 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SLC35D2Q76EJ3 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC35D2Q76EJ3 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SLC35D2Q76EJ3 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC35D2Q76EJ3 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC35D2Q76EJ3 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC35D2Q76EJ3 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SLC35D2Q76EJ3 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC35D2Q76EJ3 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC35D2Q76EJ3 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC35D2Q76EJ3 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC35D2Q76EJ3 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC35D2Q76EJ3 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC35D2Q76EJ3 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC35D2Q76EJ3 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC35D2Q76EJ3 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SLC35D2Q76EJ3 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SLC35D2Q76EJ3 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC35D2Q76EJ3 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC35D2Q76EJ3 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC35D2Q76EJ3 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC35D2Q76EJ3 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC35D2Q76EJ3 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC35D2Q76EJ3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC35D2Q76EJ3 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC35D2Q76EJ3 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC35D2Q76EJ3 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC35D2Q76EJ3 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SLC35D2Q76EJ3 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC35D2Q76EJ3 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC35D2Q76EJ3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC35D2Q76EJ3 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC35D2Q76EJ3 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC35D2Q76EJ3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SLC35D2Q76EJ3 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC35D2Q76EJ3 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC35D2Q76EJ3 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC35D2Q76EJ3 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC35D2Q76EJ3 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC35D2Q76EJ3 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC35D2Q76EJ3 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC35D2Q76EJ3 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC35D2Q76EJ3 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC35D2Q76EJ3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC35D2Q76EJ3 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC35D2Q76EJ3 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC35D2Q76EJ3 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC35D2Q76EJ3 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC35D2Q76EJ3 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC35D2Q76EJ3 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC35D2Q76EJ3 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC35D2Q76EJ3 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC35D2Q76EJ3 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC35D2Q76EJ3 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC35D2Q76EJ3 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC35D2Q76EJ3 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC35D2Q76EJ3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC35D2Q76EJ3 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC35D2Q76EJ3 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC35D2Q76EJ3 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC35D2Q76EJ3 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC35D2Q76EJ3 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC35D2Q76EJ3 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC35D2Q76EJ3 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC35D2Q76EJ3 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC35D2Q76EJ3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC35D2Q76EJ3 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC35D2Q76EJ3 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC35D2Q76EJ3 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC35D2Q76EJ3 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC35D2Q76EJ3 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC35D2Q76EJ3 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC35D2Q76EJ3 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC35D2Q76EJ3 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC35D2Q76EJ3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms