Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZNJ1

NBEAL2, Neurobeachin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,754 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBEAL2Q6ZNJ1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NBEAL2Q6ZNJ1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
NBEAL2Q6ZNJ1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NBEAL2Q6ZNJ1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NBEAL2Q6ZNJ1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NBEAL2Q6ZNJ1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NBEAL2Q6ZNJ1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NBEAL2Q6ZNJ1 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NBEAL2Q6ZNJ1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NBEAL2Q6ZNJ1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NBEAL2Q6ZNJ1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NBEAL2Q6ZNJ1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NBEAL2Q6ZNJ1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NBEAL2Q6ZNJ1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBEAL2Q6ZNJ1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NBEAL2Q6ZNJ1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NBEAL2Q6ZNJ1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NBEAL2Q6ZNJ1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBEAL2Q6ZNJ1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NBEAL2Q6ZNJ1 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NBEAL2Q6ZNJ1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NBEAL2Q6ZNJ1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NBEAL2Q6ZNJ1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NBEAL2Q6ZNJ1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBEAL2Q6ZNJ1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NBEAL2Q6ZNJ1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NBEAL2Q6ZNJ1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NBEAL2Q6ZNJ1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NBEAL2Q6ZNJ1 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
NBEAL2Q6ZNJ1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NBEAL2Q6ZNJ1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBEAL2Q6ZNJ1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NBEAL2Q6ZNJ1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
NBEAL2Q6ZNJ1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
NBEAL2Q6ZNJ1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NBEAL2Q6ZNJ1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NBEAL2Q6ZNJ1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
NBEAL2Q6ZNJ1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
NBEAL2Q6ZNJ1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
NBEAL2Q6ZNJ1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NBEAL2Q6ZNJ1 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBEAL2Q6ZNJ1 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NBEAL2Q6ZNJ1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBEAL2Q6ZNJ1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NBEAL2Q6ZNJ1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NBEAL2Q6ZNJ1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NBEAL2Q6ZNJ1 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NBEAL2Q6ZNJ1 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBEAL2Q6ZNJ1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NBEAL2Q6ZNJ1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NBEAL2Q6ZNJ1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NBEAL2Q6ZNJ1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NBEAL2Q6ZNJ1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NBEAL2Q6ZNJ1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBEAL2Q6ZNJ1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NBEAL2Q6ZNJ1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NBEAL2Q6ZNJ1 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBEAL2Q6ZNJ1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NBEAL2Q6ZNJ1 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NBEAL2Q6ZNJ1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NBEAL2Q6ZNJ1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NBEAL2Q6ZNJ1 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NBEAL2Q6ZNJ1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NBEAL2Q6ZNJ1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NBEAL2Q6ZNJ1 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBEAL2Q6ZNJ1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NBEAL2Q6ZNJ1 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NBEAL2Q6ZNJ1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NBEAL2Q6ZNJ1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
NBEAL2Q6ZNJ1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NBEAL2Q6ZNJ1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NBEAL2Q6ZNJ1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBEAL2Q6ZNJ1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBEAL2Q6ZNJ1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBEAL2Q6ZNJ1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NBEAL2Q6ZNJ1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NBEAL2Q6ZNJ1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NBEAL2Q6ZNJ1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NBEAL2Q6ZNJ1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NBEAL2Q6ZNJ1 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NBEAL2Q6ZNJ1 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NBEAL2Q6ZNJ1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NBEAL2Q6ZNJ1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NBEAL2Q6ZNJ1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NBEAL2Q6ZNJ1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NBEAL2Q6ZNJ1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
NBEAL2Q6ZNJ1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NBEAL2Q6ZNJ1 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
NBEAL2Q6ZNJ1 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.07
NBEAL2Q6ZNJ1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NBEAL2Q6ZNJ1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NBEAL2Q6ZNJ1 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
NBEAL2Q6ZNJ1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
NBEAL2Q6ZNJ1 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NBEAL2Q6ZNJ1 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
NBEAL2Q6ZNJ1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NBEAL2Q6ZNJ1 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NBEAL2Q6ZNJ1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NBEAL2Q6ZNJ1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NBEAL2Q6ZNJ1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms