Protein–RNA interactions for Protein: Q6VMQ6

ATF7IP, Activating transcription factor 7-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF7IPQ6VMQ6 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC43.43■■■■■ 4.54
ATF7IPQ6VMQ6 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.12■■■■■ 4.49
ATF7IPQ6VMQ6 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC42.47■■■■■ 4.39
ATF7IPQ6VMQ6 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.35■■■■■ 4.37
ATF7IPQ6VMQ6 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
ATF7IPQ6VMQ6 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
ATF7IPQ6VMQ6 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
ATF7IPQ6VMQ6 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC41.65■■■■■ 4.26
ATF7IPQ6VMQ6 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC41.65■■■■■ 4.26
ATF7IPQ6VMQ6 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC41.36■■■■■ 4.21
ATF7IPQ6VMQ6 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
ATF7IPQ6VMQ6 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC41.22■■■■■ 4.19
ATF7IPQ6VMQ6 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
ATF7IPQ6VMQ6 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.6■■■■■ 4.09
ATF7IPQ6VMQ6 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.49■■■■■ 4.07
ATF7IPQ6VMQ6 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC40.39■■■■■ 4.06
ATF7IPQ6VMQ6 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
ATF7IPQ6VMQ6 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
ATF7IPQ6VMQ6 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
ATF7IPQ6VMQ6 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
ATF7IPQ6VMQ6 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.84■■■■□ 3.97
ATF7IPQ6VMQ6 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC39.83■■■■□ 3.97
ATF7IPQ6VMQ6 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC39.82■■■■□ 3.97
ATF7IPQ6VMQ6 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.81■■■■□ 3.96
ATF7IPQ6VMQ6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
ATF7IPQ6VMQ6 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
ATF7IPQ6VMQ6 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC39.6■■■■□ 3.93
ATF7IPQ6VMQ6 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC39.52■■■■□ 3.92
ATF7IPQ6VMQ6 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC39.43■■■■□ 3.9
ATF7IPQ6VMQ6 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
ATF7IPQ6VMQ6 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.23■■■■□ 3.87
ATF7IPQ6VMQ6 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.11■■■■□ 3.85
ATF7IPQ6VMQ6 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
ATF7IPQ6VMQ6 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
ATF7IPQ6VMQ6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC38.95■■■■□ 3.83
ATF7IPQ6VMQ6 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.92■■■■□ 3.82
ATF7IPQ6VMQ6 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
ATF7IPQ6VMQ6 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
ATF7IPQ6VMQ6 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
ATF7IPQ6VMQ6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.63■■■■□ 3.77
ATF7IPQ6VMQ6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC38.63■■■■□ 3.77
ATF7IPQ6VMQ6 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.61■■■■□ 3.77
ATF7IPQ6VMQ6 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
ATF7IPQ6VMQ6 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC38.52■■■■□ 3.76
ATF7IPQ6VMQ6 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
ATF7IPQ6VMQ6 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.42■■■■□ 3.74
ATF7IPQ6VMQ6 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
ATF7IPQ6VMQ6 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
ATF7IPQ6VMQ6 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
ATF7IPQ6VMQ6 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
ATF7IPQ6VMQ6 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
ATF7IPQ6VMQ6 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC38.29■■■■□ 3.72
ATF7IPQ6VMQ6 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
ATF7IPQ6VMQ6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
ATF7IPQ6VMQ6 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
ATF7IPQ6VMQ6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
ATF7IPQ6VMQ6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
ATF7IPQ6VMQ6 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.68
ATF7IPQ6VMQ6 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
ATF7IPQ6VMQ6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
ATF7IPQ6VMQ6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
ATF7IPQ6VMQ6 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.91■■■■□ 3.66
ATF7IPQ6VMQ6 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
ATF7IPQ6VMQ6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
ATF7IPQ6VMQ6 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
ATF7IPQ6VMQ6 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
ATF7IPQ6VMQ6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
ATF7IPQ6VMQ6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
ATF7IPQ6VMQ6 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
ATF7IPQ6VMQ6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
ATF7IPQ6VMQ6 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
ATF7IPQ6VMQ6 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
ATF7IPQ6VMQ6 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
ATF7IPQ6VMQ6 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC37.45■■■■□ 3.59
ATF7IPQ6VMQ6 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
ATF7IPQ6VMQ6 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC37.4■■■■□ 3.58
ATF7IPQ6VMQ6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
ATF7IPQ6VMQ6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
ATF7IPQ6VMQ6 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC37.33■■■■□ 3.57
ATF7IPQ6VMQ6 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
ATF7IPQ6VMQ6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
ATF7IPQ6VMQ6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
ATF7IPQ6VMQ6 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
ATF7IPQ6VMQ6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
ATF7IPQ6VMQ6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
ATF7IPQ6VMQ6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
ATF7IPQ6VMQ6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
ATF7IPQ6VMQ6 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
ATF7IPQ6VMQ6 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
ATF7IPQ6VMQ6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
ATF7IPQ6VMQ6 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
ATF7IPQ6VMQ6 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
ATF7IPQ6VMQ6 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
ATF7IPQ6VMQ6 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
ATF7IPQ6VMQ6 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
ATF7IPQ6VMQ6 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC36.95■■■■□ 3.51
ATF7IPQ6VMQ6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.5
ATF7IPQ6VMQ6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
ATF7IPQ6VMQ6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC36.82■■■■□ 3.48
ATF7IPQ6VMQ6 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms