Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW01

CBLN3, Cerebellin-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBLN3Q6UW01 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CBLN3Q6UW01 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CBLN3Q6UW01 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
CBLN3Q6UW01 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
CBLN3Q6UW01 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
CBLN3Q6UW01 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
CBLN3Q6UW01 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CBLN3Q6UW01 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CBLN3Q6UW01 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
CBLN3Q6UW01 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CBLN3Q6UW01 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CBLN3Q6UW01 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CBLN3Q6UW01 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CBLN3Q6UW01 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CBLN3Q6UW01 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CBLN3Q6UW01 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CBLN3Q6UW01 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CBLN3Q6UW01 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CBLN3Q6UW01 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CBLN3Q6UW01 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CBLN3Q6UW01 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CBLN3Q6UW01 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CBLN3Q6UW01 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
CBLN3Q6UW01 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.15
CBLN3Q6UW01 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CBLN3Q6UW01 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CBLN3Q6UW01 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CBLN3Q6UW01 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CBLN3Q6UW01 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CBLN3Q6UW01 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CBLN3Q6UW01 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CBLN3Q6UW01 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CBLN3Q6UW01 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CBLN3Q6UW01 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CBLN3Q6UW01 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CBLN3Q6UW01 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CBLN3Q6UW01 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CBLN3Q6UW01 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CBLN3Q6UW01 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CBLN3Q6UW01 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CBLN3Q6UW01 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CBLN3Q6UW01 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CBLN3Q6UW01 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CBLN3Q6UW01 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CBLN3Q6UW01 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CBLN3Q6UW01 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CBLN3Q6UW01 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CBLN3Q6UW01 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CBLN3Q6UW01 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CBLN3Q6UW01 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CBLN3Q6UW01 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CBLN3Q6UW01 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CBLN3Q6UW01 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CBLN3Q6UW01 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CBLN3Q6UW01 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CBLN3Q6UW01 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
CBLN3Q6UW01 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CBLN3Q6UW01 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CBLN3Q6UW01 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CBLN3Q6UW01 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CBLN3Q6UW01 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CBLN3Q6UW01 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CBLN3Q6UW01 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CBLN3Q6UW01 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CBLN3Q6UW01 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CBLN3Q6UW01 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CBLN3Q6UW01 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CBLN3Q6UW01 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CBLN3Q6UW01 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CBLN3Q6UW01 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CBLN3Q6UW01 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CBLN3Q6UW01 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CBLN3Q6UW01 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CBLN3Q6UW01 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CBLN3Q6UW01 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CBLN3Q6UW01 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CBLN3Q6UW01 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CBLN3Q6UW01 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CBLN3Q6UW01 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CBLN3Q6UW01 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CBLN3Q6UW01 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
CBLN3Q6UW01 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CBLN3Q6UW01 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CBLN3Q6UW01 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
CBLN3Q6UW01 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
CBLN3Q6UW01 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CBLN3Q6UW01 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CBLN3Q6UW01 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CBLN3Q6UW01 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CBLN3Q6UW01 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CBLN3Q6UW01 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CBLN3Q6UW01 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CBLN3Q6UW01 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
CBLN3Q6UW01 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CBLN3Q6UW01 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CBLN3Q6UW01 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CBLN3Q6UW01 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CBLN3Q6UW01 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CBLN3Q6UW01 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CBLN3Q6UW01 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms