Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3W7

SCYL2, SCY1-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCYL2Q6P3W7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.47■■■■□ 3.27
SCYL2Q6P3W7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
SCYL2Q6P3W7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
SCYL2Q6P3W7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SCYL2Q6P3W7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
SCYL2Q6P3W7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SCYL2Q6P3W7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SCYL2Q6P3W7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
SCYL2Q6P3W7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
SCYL2Q6P3W7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
SCYL2Q6P3W7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SCYL2Q6P3W7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SCYL2Q6P3W7 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
SCYL2Q6P3W7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SCYL2Q6P3W7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SCYL2Q6P3W7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
SCYL2Q6P3W7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.05■■■□□ 2.88
SCYL2Q6P3W7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
SCYL2Q6P3W7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SCYL2Q6P3W7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SCYL2Q6P3W7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SCYL2Q6P3W7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SCYL2Q6P3W7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SCYL2Q6P3W7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
SCYL2Q6P3W7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
SCYL2Q6P3W7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
SCYL2Q6P3W7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
SCYL2Q6P3W7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
SCYL2Q6P3W7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SCYL2Q6P3W7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SCYL2Q6P3W7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SCYL2Q6P3W7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
SCYL2Q6P3W7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
SCYL2Q6P3W7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
SCYL2Q6P3W7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SCYL2Q6P3W7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SCYL2Q6P3W7 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SCYL2Q6P3W7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SCYL2Q6P3W7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SCYL2Q6P3W7 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SCYL2Q6P3W7 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
SCYL2Q6P3W7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SCYL2Q6P3W7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SCYL2Q6P3W7 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SCYL2Q6P3W7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
SCYL2Q6P3W7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SCYL2Q6P3W7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SCYL2Q6P3W7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
SCYL2Q6P3W7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SCYL2Q6P3W7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SCYL2Q6P3W7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SCYL2Q6P3W7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SCYL2Q6P3W7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SCYL2Q6P3W7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SCYL2Q6P3W7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
SCYL2Q6P3W7 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
SCYL2Q6P3W7 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
SCYL2Q6P3W7 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
SCYL2Q6P3W7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SCYL2Q6P3W7 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
SCYL2Q6P3W7 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.56
SCYL2Q6P3W7 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
SCYL2Q6P3W7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
SCYL2Q6P3W7 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SCYL2Q6P3W7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SCYL2Q6P3W7 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SCYL2Q6P3W7 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
SCYL2Q6P3W7 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
SCYL2Q6P3W7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
SCYL2Q6P3W7 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
SCYL2Q6P3W7 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
SCYL2Q6P3W7 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
SCYL2Q6P3W7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
SCYL2Q6P3W7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
SCYL2Q6P3W7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
SCYL2Q6P3W7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
SCYL2Q6P3W7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
SCYL2Q6P3W7 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
SCYL2Q6P3W7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
SCYL2Q6P3W7 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
SCYL2Q6P3W7 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SCYL2Q6P3W7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
SCYL2Q6P3W7 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
SCYL2Q6P3W7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
SCYL2Q6P3W7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
SCYL2Q6P3W7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
SCYL2Q6P3W7 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
SCYL2Q6P3W7 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
SCYL2Q6P3W7 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
SCYL2Q6P3W7 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.3■■■□□ 2.44
SCYL2Q6P3W7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
SCYL2Q6P3W7 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
SCYL2Q6P3W7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
SCYL2Q6P3W7 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
SCYL2Q6P3W7 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
SCYL2Q6P3W7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
SCYL2Q6P3W7 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
SCYL2Q6P3W7 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
SCYL2Q6P3W7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
SCYL2Q6P3W7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 263.6 ms