Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYC1

CLVS2, Clavesin-2, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS2Q5SYC1 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CLVS2Q5SYC1 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CLVS2Q5SYC1 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CLVS2Q5SYC1 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CLVS2Q5SYC1 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CLVS2Q5SYC1 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLVS2Q5SYC1 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLVS2Q5SYC1 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLVS2Q5SYC1 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLVS2Q5SYC1 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLVS2Q5SYC1 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLVS2Q5SYC1 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CLVS2Q5SYC1 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CLVS2Q5SYC1 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CLVS2Q5SYC1 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
CLVS2Q5SYC1 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLVS2Q5SYC1 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLVS2Q5SYC1 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CLVS2Q5SYC1 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLVS2Q5SYC1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLVS2Q5SYC1 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLVS2Q5SYC1 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLVS2Q5SYC1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLVS2Q5SYC1 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLVS2Q5SYC1 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CLVS2Q5SYC1 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CLVS2Q5SYC1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CLVS2Q5SYC1 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CLVS2Q5SYC1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CLVS2Q5SYC1 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
CLVS2Q5SYC1 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CLVS2Q5SYC1 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CLVS2Q5SYC1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CLVS2Q5SYC1 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CLVS2Q5SYC1 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CLVS2Q5SYC1 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CLVS2Q5SYC1 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CLVS2Q5SYC1 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CLVS2Q5SYC1 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CLVS2Q5SYC1 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
CLVS2Q5SYC1 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
CLVS2Q5SYC1 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CLVS2Q5SYC1 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CLVS2Q5SYC1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CLVS2Q5SYC1 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CLVS2Q5SYC1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CLVS2Q5SYC1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CLVS2Q5SYC1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CLVS2Q5SYC1 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CLVS2Q5SYC1 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLVS2Q5SYC1 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLVS2Q5SYC1 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLVS2Q5SYC1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLVS2Q5SYC1 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLVS2Q5SYC1 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLVS2Q5SYC1 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLVS2Q5SYC1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLVS2Q5SYC1 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CLVS2Q5SYC1 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CLVS2Q5SYC1 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CLVS2Q5SYC1 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CLVS2Q5SYC1 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLVS2Q5SYC1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CLVS2Q5SYC1 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CLVS2Q5SYC1 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLVS2Q5SYC1 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CLVS2Q5SYC1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLVS2Q5SYC1 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CLVS2Q5SYC1 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CLVS2Q5SYC1 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CLVS2Q5SYC1 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CLVS2Q5SYC1 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CLVS2Q5SYC1 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CLVS2Q5SYC1 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CLVS2Q5SYC1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CLVS2Q5SYC1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CLVS2Q5SYC1 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLVS2Q5SYC1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CLVS2Q5SYC1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CLVS2Q5SYC1 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CLVS2Q5SYC1 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CLVS2Q5SYC1 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CLVS2Q5SYC1 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CLVS2Q5SYC1 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLVS2Q5SYC1 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CLVS2Q5SYC1 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLVS2Q5SYC1 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CLVS2Q5SYC1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CLVS2Q5SYC1 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLVS2Q5SYC1 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CLVS2Q5SYC1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CLVS2Q5SYC1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CLVS2Q5SYC1 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLVS2Q5SYC1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CLVS2Q5SYC1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CLVS2Q5SYC1 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CLVS2Q5SYC1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CLVS2Q5SYC1 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CLVS2Q5SYC1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CLVS2Q5SYC1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms