Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC53.28■■■■■ 6.12
FRMPD1Q5SYB0 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC53.01■■■■■ 6.08
FRMPD1Q5SYB0 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC52.66■■■■■ 6.02
FRMPD1Q5SYB0 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.91■■■■■ 5.9
FRMPD1Q5SYB0 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.26■■■■■ 5.8
FRMPD1Q5SYB0 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC50.98■■■■■ 5.75
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.83■■■■■ 5.73
FRMPD1Q5SYB0 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC50.8■■■■■ 5.72
FRMPD1Q5SYB0 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC50.73■■■■■ 5.71
FRMPD1Q5SYB0 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC50.7■■■■■ 5.71
FRMPD1Q5SYB0 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.6■■■■■ 5.69
FRMPD1Q5SYB0 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC50.5■■■■■ 5.67
FRMPD1Q5SYB0 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC50.35■■■■■ 5.65
FRMPD1Q5SYB0 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC50.09■■■■■ 5.61
FRMPD1Q5SYB0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.08■■■■■ 5.61
FRMPD1Q5SYB0 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.04■■■■■ 5.6
FRMPD1Q5SYB0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC49.83■■■■■ 5.57
FRMPD1Q5SYB0 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.51■■■■■ 5.52
FRMPD1Q5SYB0 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC49.43■■■■■ 5.5
FRMPD1Q5SYB0 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.4■■■■■ 5.5
FRMPD1Q5SYB0 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.28■■■■■ 5.48
FRMPD1Q5SYB0 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC49.28■■■■■ 5.48
FRMPD1Q5SYB0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC49.11■■■■■ 5.45
FRMPD1Q5SYB0 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC49.09■■■■■ 5.45
FRMPD1Q5SYB0 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.07■■■■■ 5.45
FRMPD1Q5SYB0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.85■■■■■ 5.41
FRMPD1Q5SYB0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC48.81■■■■■ 5.4
FRMPD1Q5SYB0 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC48.79■■■■■ 5.4
FRMPD1Q5SYB0 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC48.71■■■■■ 5.39
FRMPD1Q5SYB0 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC48.67■■■■■ 5.38
FRMPD1Q5SYB0 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.65■■■■■ 5.38
FRMPD1Q5SYB0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.38■■■■■ 5.33
FRMPD1Q5SYB0 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC48.14■■■■■ 5.3
FRMPD1Q5SYB0 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.04■■■■■ 5.28
FRMPD1Q5SYB0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC48■■■■■ 5.27
FRMPD1Q5SYB0 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC47.93■■■■■ 5.26
FRMPD1Q5SYB0 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC47.88■■■■■ 5.26
FRMPD1Q5SYB0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC47.71■■■■■ 5.23
FRMPD1Q5SYB0 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC47.53■■■■■ 5.2
FRMPD1Q5SYB0 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.42■■■■■ 5.18
FRMPD1Q5SYB0 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.36■■■■■ 5.17
FRMPD1Q5SYB0 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC47.32■■■■■ 5.17
FRMPD1Q5SYB0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.31■■■■■ 5.16
FRMPD1Q5SYB0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC47.29■■■■■ 5.16
FRMPD1Q5SYB0 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC47.21■■■■■ 5.15
FRMPD1Q5SYB0 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC47.21■■■■■ 5.15
FRMPD1Q5SYB0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC47.07■■■■■ 5.13
FRMPD1Q5SYB0 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC47.02■■■■■ 5.12
FRMPD1Q5SYB0 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC47.02■■■■■ 5.12
FRMPD1Q5SYB0 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC47.01■■■■■ 5.12
FRMPD1Q5SYB0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC47.01■■■■■ 5.12
FRMPD1Q5SYB0 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC46.95■■■■■ 5.11
FRMPD1Q5SYB0 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.94■■■■■ 5.11
FRMPD1Q5SYB0 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC46.89■■■■■ 5.1
FRMPD1Q5SYB0 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC46.89■■■■■ 5.1
FRMPD1Q5SYB0 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.88■■■■■ 5.1
FRMPD1Q5SYB0 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC46.83■■■■■ 5.09
FRMPD1Q5SYB0 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC46.81■■■■■ 5.08
FRMPD1Q5SYB0 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.66■■■■■ 5.06
FRMPD1Q5SYB0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.64■■■■■ 5.06
FRMPD1Q5SYB0 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.62■■■■■ 5.05
FRMPD1Q5SYB0 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.6■■■■■ 5.05
FRMPD1Q5SYB0 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC46.58■■■■■ 5.05
FRMPD1Q5SYB0 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.56■■■■■ 5.04
FRMPD1Q5SYB0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC46.56■■■■■ 5.04
FRMPD1Q5SYB0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC46.52■■■■■ 5.04
FRMPD1Q5SYB0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.36■■■■■ 5.01
FRMPD1Q5SYB0 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC46.31■■■■■ 5
FRMPD1Q5SYB0 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
FRMPD1Q5SYB0 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.25■■■■■ 5
FRMPD1Q5SYB0 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
FRMPD1Q5SYB0 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC46.18■■■■■ 4.98
FRMPD1Q5SYB0 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.12■■■■■ 4.97
FRMPD1Q5SYB0 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC46.12■■■■■ 4.97
FRMPD1Q5SYB0 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC46.11■■■■■ 4.97
FRMPD1Q5SYB0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC46.07■■■■■ 4.97
FRMPD1Q5SYB0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
FRMPD1Q5SYB0 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC46.03■■■■■ 4.96
FRMPD1Q5SYB0 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.99■■■■■ 4.95
FRMPD1Q5SYB0 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
FRMPD1Q5SYB0 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.96■■■■■ 4.95
FRMPD1Q5SYB0 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.93■■■■■ 4.94
FRMPD1Q5SYB0 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
FRMPD1Q5SYB0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC45.88■■■■■ 4.93
FRMPD1Q5SYB0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC45.86■■■■■ 4.93
FRMPD1Q5SYB0 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC45.85■■■■■ 4.93
FRMPD1Q5SYB0 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC45.85■■■■■ 4.93
FRMPD1Q5SYB0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC45.84■■■■■ 4.93
FRMPD1Q5SYB0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC45.84■■■■■ 4.93
FRMPD1Q5SYB0 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC45.81■■■■■ 4.92
FRMPD1Q5SYB0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.79■■■■■ 4.92
FRMPD1Q5SYB0 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC45.75■■■■■ 4.91
FRMPD1Q5SYB0 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC45.74■■■■■ 4.91
FRMPD1Q5SYB0 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
FRMPD1Q5SYB0 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC45.71■■■■■ 4.91
FRMPD1Q5SYB0 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.71■■■■■ 4.91
FRMPD1Q5SYB0 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
FRMPD1Q5SYB0 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC45.68■■■■■ 4.9
FRMPD1Q5SYB0 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
FRMPD1Q5SYB0 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC45.68■■■■■ 4.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms