Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.66■■■■■ 4.9
FRMPD1Q5SYB0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.65■■■■■ 4.9
FRMPD1Q5SYB0 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
FRMPD1Q5SYB0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
FRMPD1Q5SYB0 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC45.6■■■■■ 4.89
FRMPD1Q5SYB0 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC45.58■■■■■ 4.89
FRMPD1Q5SYB0 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC45.53■■■■■ 4.88
FRMPD1Q5SYB0 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.5■■■■■ 4.87
FRMPD1Q5SYB0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.44■■■■■ 4.86
FRMPD1Q5SYB0 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC45.37■■■■■ 4.85
FRMPD1Q5SYB0 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC45.3■■■■■ 4.84
FRMPD1Q5SYB0 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
FRMPD1Q5SYB0 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC45.24■■■■■ 4.83
FRMPD1Q5SYB0 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC45.19■■■■■ 4.82
FRMPD1Q5SYB0 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC45.13■■■■■ 4.82
FRMPD1Q5SYB0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.04■■■■■ 4.8
FRMPD1Q5SYB0 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.04■■■■■ 4.8
FRMPD1Q5SYB0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC45.03■■■■■ 4.8
FRMPD1Q5SYB0 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC45.03■■■■■ 4.8
FRMPD1Q5SYB0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC45.01■■■■■ 4.8
FRMPD1Q5SYB0 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.99■■■■■ 4.79
FRMPD1Q5SYB0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.89■■■■■ 4.78
FRMPD1Q5SYB0 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC44.89■■■■■ 4.78
FRMPD1Q5SYB0 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.86■■■■■ 4.77
FRMPD1Q5SYB0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC44.82■■■■■ 4.77
FRMPD1Q5SYB0 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.81■■■■■ 4.76
FRMPD1Q5SYB0 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
FRMPD1Q5SYB0 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
FRMPD1Q5SYB0 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.78■■■■■ 4.76
FRMPD1Q5SYB0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC44.73■■■■■ 4.75
FRMPD1Q5SYB0 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
FRMPD1Q5SYB0 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.72■■■■■ 4.75
FRMPD1Q5SYB0 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.71■■■■■ 4.75
FRMPD1Q5SYB0 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC44.66■■■■■ 4.74
FRMPD1Q5SYB0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC44.64■■■■■ 4.74
FRMPD1Q5SYB0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC44.63■■■■■ 4.73
FRMPD1Q5SYB0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC44.59■■■■■ 4.73
FRMPD1Q5SYB0 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC44.58■■■■■ 4.73
FRMPD1Q5SYB0 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC44.57■■■■■ 4.73
FRMPD1Q5SYB0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.55■■■■■ 4.72
FRMPD1Q5SYB0 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.54■■■■■ 4.72
FRMPD1Q5SYB0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC44.54■■■■■ 4.72
FRMPD1Q5SYB0 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC44.52■■■■■ 4.72
FRMPD1Q5SYB0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC44.51■■■■■ 4.72
FRMPD1Q5SYB0 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC44.51■■■■■ 4.72
FRMPD1Q5SYB0 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC44.47■■■■■ 4.71
FRMPD1Q5SYB0 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC44.46■■■■■ 4.71
FRMPD1Q5SYB0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC44.45■■■■■ 4.71
FRMPD1Q5SYB0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC44.44■■■■■ 4.71
FRMPD1Q5SYB0 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC44.43■■■■■ 4.7
FRMPD1Q5SYB0 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC44.39■■■■■ 4.7
FRMPD1Q5SYB0 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC44.35■■■■■ 4.69
FRMPD1Q5SYB0 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
FRMPD1Q5SYB0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC44.28■■■■■ 4.68
FRMPD1Q5SYB0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC44.27■■■■■ 4.68
FRMPD1Q5SYB0 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
FRMPD1Q5SYB0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.2■■■■■ 4.67
FRMPD1Q5SYB0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC44.18■■■■■ 4.66
FRMPD1Q5SYB0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC44.17■■■■■ 4.66
FRMPD1Q5SYB0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.15■■■■■ 4.66
FRMPD1Q5SYB0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.1■■■■■ 4.65
FRMPD1Q5SYB0 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC44.1■■■■■ 4.65
FRMPD1Q5SYB0 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC44.09■■■■■ 4.65
FRMPD1Q5SYB0 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC44.08■■■■■ 4.65
FRMPD1Q5SYB0 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC44.05■■■■■ 4.64
FRMPD1Q5SYB0 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC44.01■■■■■ 4.64
FRMPD1Q5SYB0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.95■■■■■ 4.63
FRMPD1Q5SYB0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC43.95■■■■■ 4.63
FRMPD1Q5SYB0 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.95■■■■■ 4.63
FRMPD1Q5SYB0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.94■■■■■ 4.62
FRMPD1Q5SYB0 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
FRMPD1Q5SYB0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC43.93■■■■■ 4.62
FRMPD1Q5SYB0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.92■■■■■ 4.62
FRMPD1Q5SYB0 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
FRMPD1Q5SYB0 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
FRMPD1Q5SYB0 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
FRMPD1Q5SYB0 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
FRMPD1Q5SYB0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC43.84■■■■■ 4.61
FRMPD1Q5SYB0 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC43.84■■■■■ 4.61
FRMPD1Q5SYB0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC43.79■■■■■ 4.6
FRMPD1Q5SYB0 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.78■■■■■ 4.6
FRMPD1Q5SYB0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
FRMPD1Q5SYB0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.75■■■■■ 4.59
FRMPD1Q5SYB0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
FRMPD1Q5SYB0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC43.7■■■■■ 4.59
FRMPD1Q5SYB0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC43.7■■■■■ 4.59
FRMPD1Q5SYB0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC43.67■■■■■ 4.58
FRMPD1Q5SYB0 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC43.66■■■■■ 4.58
FRMPD1Q5SYB0 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC43.66■■■■■ 4.58
FRMPD1Q5SYB0 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
FRMPD1Q5SYB0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.63■■■■■ 4.58
FRMPD1Q5SYB0 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.58■■■■■ 4.57
FRMPD1Q5SYB0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC43.57■■■■■ 4.57
FRMPD1Q5SYB0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
FRMPD1Q5SYB0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
FRMPD1Q5SYB0 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC43.52■■■■■ 4.56
FRMPD1Q5SYB0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC43.49■■■■■ 4.55
FRMPD1Q5SYB0 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
FRMPD1Q5SYB0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC43.49■■■■■ 4.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms