Protein–RNA interactions for Protein: Q5K651

SAMD9, Sterile alpha motif domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD9Q5K651 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC55.65■■■■■ 6.5
SAMD9Q5K651 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC54.93■■■■■ 6.38
SAMD9Q5K651 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.29■■■■■ 6.28
SAMD9Q5K651 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC54.11■■■■■ 6.25
SAMD9Q5K651 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.86■■■■■ 6.21
SAMD9Q5K651 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC53.61■■■■■ 6.17
SAMD9Q5K651 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.55■■■■■ 6.16
SAMD9Q5K651 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC53.26■■■■■ 6.12
SAMD9Q5K651 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC52.51■■■■■ 6
SAMD9Q5K651 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC52.41■■■■■ 5.98
SAMD9Q5K651 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC52.38■■■■■ 5.98
SAMD9Q5K651 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC52.37■■■■■ 5.97
SAMD9Q5K651 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC52.06■■■■■ 5.92
SAMD9Q5K651 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC52■■■■■ 5.91
SAMD9Q5K651 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.95■■■■■ 5.91
SAMD9Q5K651 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC51.76■■■■■ 5.88
SAMD9Q5K651 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC51.71■■■■■ 5.87
SAMD9Q5K651 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC51.68■■■■■ 5.86
SAMD9Q5K651 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.5■■■■■ 5.84
SAMD9Q5K651 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.28■■■■■ 5.8
SAMD9Q5K651 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC51.18■■■■■ 5.78
SAMD9Q5K651 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.12■■■■■ 5.77
SAMD9Q5K651 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC51.09■■■■■ 5.77
SAMD9Q5K651 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.88■■■■■ 5.74
SAMD9Q5K651 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC50.88■■■■■ 5.74
SAMD9Q5K651 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC50.83■■■■■ 5.73
SAMD9Q5K651 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.73■■■■■ 5.71
SAMD9Q5K651 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC50.63■■■■■ 5.7
SAMD9Q5K651 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC50.4■■■■■ 5.66
SAMD9Q5K651 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC50.38■■■■■ 5.66
SAMD9Q5K651 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.33■■■■■ 5.65
SAMD9Q5K651 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC50.24■■■■■ 5.63
SAMD9Q5K651 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC50.05■■■■■ 5.6
SAMD9Q5K651 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC49.98■■■■■ 5.59
SAMD9Q5K651 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC49.89■■■■■ 5.58
SAMD9Q5K651 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC49.82■■■■■ 5.57
SAMD9Q5K651 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC49.74■■■■■ 5.55
SAMD9Q5K651 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC49.64■■■■■ 5.54
SAMD9Q5K651 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC49.62■■■■■ 5.53
SAMD9Q5K651 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC49.56■■■■■ 5.52
SAMD9Q5K651 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.43■■■■■ 5.5
SAMD9Q5K651 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC49.31■■■■■ 5.48
SAMD9Q5K651 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC49.25■■■■■ 5.48
SAMD9Q5K651 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC49.18■■■■■ 5.46
SAMD9Q5K651 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC49.14■■■■■ 5.46
SAMD9Q5K651 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC49.11■■■■■ 5.45
SAMD9Q5K651 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC49.06■■■■■ 5.44
SAMD9Q5K651 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC48.88■■■■■ 5.42
SAMD9Q5K651 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC48.86■■■■■ 5.41
SAMD9Q5K651 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC48.75■■■■■ 5.39
SAMD9Q5K651 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.74■■■■■ 5.39
SAMD9Q5K651 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC48.47■■■■■ 5.35
SAMD9Q5K651 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC48.46■■■■■ 5.35
SAMD9Q5K651 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC48.41■■■■■ 5.34
SAMD9Q5K651 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC48.4■■■■■ 5.34
SAMD9Q5K651 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC48.33■■■■■ 5.33
SAMD9Q5K651 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.27■■■■■ 5.32
SAMD9Q5K651 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC48.21■■■■■ 5.31
SAMD9Q5K651 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.2■■■■■ 5.31
SAMD9Q5K651 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.17■■■■■ 5.3
SAMD9Q5K651 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC48.16■■■■■ 5.3
SAMD9Q5K651 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC48.13■■■■■ 5.3
SAMD9Q5K651 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.07■■■■■ 5.29
SAMD9Q5K651 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.05■■■■■ 5.28
SAMD9Q5K651 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC48.05■■■■■ 5.28
SAMD9Q5K651 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC48.05■■■■■ 5.28
SAMD9Q5K651 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.96■■■■■ 5.27
SAMD9Q5K651 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC47.95■■■■■ 5.27
SAMD9Q5K651 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC47.95■■■■■ 5.27
SAMD9Q5K651 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC47.93■■■■■ 5.26
SAMD9Q5K651 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC47.92■■■■■ 5.26
SAMD9Q5K651 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC47.91■■■■■ 5.26
SAMD9Q5K651 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC47.89■■■■■ 5.26
SAMD9Q5K651 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.85■■■■■ 5.25
SAMD9Q5K651 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC47.82■■■■■ 5.25
SAMD9Q5K651 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.82■■■■■ 5.25
SAMD9Q5K651 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.79■■■■■ 5.24
SAMD9Q5K651 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC47.77■■■■■ 5.24
SAMD9Q5K651 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.77■■■■■ 5.24
SAMD9Q5K651 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC47.76■■■■■ 5.24
SAMD9Q5K651 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.76■■■■■ 5.24
SAMD9Q5K651 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC47.71■■■■■ 5.23
SAMD9Q5K651 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC47.67■■■■■ 5.22
SAMD9Q5K651 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC47.63■■■■■ 5.22
SAMD9Q5K651 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC47.62■■■■■ 5.21
SAMD9Q5K651 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.61■■■■■ 5.21
SAMD9Q5K651 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.6■■■■■ 5.21
SAMD9Q5K651 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC47.6■■■■■ 5.21
SAMD9Q5K651 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC47.57■■■■■ 5.21
SAMD9Q5K651 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.56■■■■■ 5.2
SAMD9Q5K651 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC47.54■■■■■ 5.2
SAMD9Q5K651 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC47.54■■■■■ 5.2
SAMD9Q5K651 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.48■■■■■ 5.19
SAMD9Q5K651 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.36■■■■■ 5.17
SAMD9Q5K651 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.34■■■■■ 5.17
SAMD9Q5K651 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.29■■■■■ 5.16
SAMD9Q5K651 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC47.25■■■■■ 5.15
SAMD9Q5K651 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.2■■■■■ 5.15
SAMD9Q5K651 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC47.16■■■■■ 5.14
SAMD9Q5K651 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC47.15■■■■■ 5.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms