Protein–RNA interactions for Protein: Q5K651

SAMD9, Sterile alpha motif domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD9Q5K651 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC47.15■■■■■ 5.14
SAMD9Q5K651 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC47.14■■■■■ 5.14
SAMD9Q5K651 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC47.13■■■■■ 5.14
SAMD9Q5K651 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.13■■■■■ 5.13
SAMD9Q5K651 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.07■■■■■ 5.12
SAMD9Q5K651 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC47■■■■■ 5.11
SAMD9Q5K651 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC46.99■■■■■ 5.11
SAMD9Q5K651 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC46.94■■■■■ 5.1
SAMD9Q5K651 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.91■■■■■ 5.1
SAMD9Q5K651 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC46.91■■■■■ 5.1
SAMD9Q5K651 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC46.87■■■■■ 5.09
SAMD9Q5K651 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC46.86■■■■■ 5.09
SAMD9Q5K651 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.84■■■■■ 5.09
SAMD9Q5K651 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC46.83■■■■■ 5.09
SAMD9Q5K651 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.76■■■■■ 5.08
SAMD9Q5K651 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.73■■■■■ 5.07
SAMD9Q5K651 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.68■■■■■ 5.06
SAMD9Q5K651 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.67■■■■■ 5.06
SAMD9Q5K651 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.64■■■■■ 5.06
SAMD9Q5K651 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC46.64■■■■■ 5.06
SAMD9Q5K651 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC46.64■■■■■ 5.06
SAMD9Q5K651 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC46.6■■■■■ 5.05
SAMD9Q5K651 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC46.54■■■■■ 5.04
SAMD9Q5K651 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.53■■■■■ 5.04
SAMD9Q5K651 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC46.51■■■■■ 5.04
SAMD9Q5K651 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.5■■■■■ 5.03
SAMD9Q5K651 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC46.5■■■■■ 5.03
SAMD9Q5K651 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.48■■■■■ 5.03
SAMD9Q5K651 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC46.45■■■■■ 5.03
SAMD9Q5K651 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.43■■■■■ 5.02
SAMD9Q5K651 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC46.38■■■■■ 5.01
SAMD9Q5K651 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.36■■■■■ 5.01
SAMD9Q5K651 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC46.36■■■■■ 5.01
SAMD9Q5K651 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.32■■■■■ 5
SAMD9Q5K651 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC46.29■■■■■ 5
SAMD9Q5K651 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC46.29■■■■■ 5
SAMD9Q5K651 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC46.27■■■■■ 5
SAMD9Q5K651 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC46.25■■■■■ 4.99
SAMD9Q5K651 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.24■■■■■ 4.99
SAMD9Q5K651 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC46.22■■■■■ 4.99
SAMD9Q5K651 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC46.16■■■■■ 4.98
SAMD9Q5K651 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC46.15■■■■■ 4.98
SAMD9Q5K651 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC46.14■■■■■ 4.98
SAMD9Q5K651 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC46.13■■■■■ 4.98
SAMD9Q5K651 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.09■■■■■ 4.97
SAMD9Q5K651 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC46.09■■■■■ 4.97
SAMD9Q5K651 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
SAMD9Q5K651 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC46.04■■■■■ 4.96
SAMD9Q5K651 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.02■■■■■ 4.96
SAMD9Q5K651 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC46.02■■■■■ 4.96
SAMD9Q5K651 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC46.01■■■■■ 4.96
SAMD9Q5K651 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.01■■■■■ 4.96
SAMD9Q5K651 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC46.01■■■■■ 4.96
SAMD9Q5K651 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC45.97■■■■■ 4.95
SAMD9Q5K651 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.97■■■■■ 4.95
SAMD9Q5K651 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.97■■■■■ 4.95
SAMD9Q5K651 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC45.96■■■■■ 4.95
SAMD9Q5K651 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC45.96■■■■■ 4.95
SAMD9Q5K651 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC45.94■■■■■ 4.94
SAMD9Q5K651 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.9■■■■■ 4.94
SAMD9Q5K651 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC45.89■■■■■ 4.94
SAMD9Q5K651 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC45.87■■■■■ 4.93
SAMD9Q5K651 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
SAMD9Q5K651 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.83■■■■■ 4.93
SAMD9Q5K651 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.81■■■■■ 4.92
SAMD9Q5K651 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC45.74■■■■■ 4.91
SAMD9Q5K651 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC45.72■■■■■ 4.91
SAMD9Q5K651 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.72■■■■■ 4.91
SAMD9Q5K651 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC45.71■■■■■ 4.91
SAMD9Q5K651 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC45.69■■■■■ 4.9
SAMD9Q5K651 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC45.63■■■■■ 4.9
SAMD9Q5K651 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC45.63■■■■■ 4.9
SAMD9Q5K651 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
SAMD9Q5K651 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.58■■■■■ 4.89
SAMD9Q5K651 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC45.5■■■■■ 4.87
SAMD9Q5K651 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC45.5■■■■■ 4.87
SAMD9Q5K651 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
SAMD9Q5K651 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.49■■■■■ 4.87
SAMD9Q5K651 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC45.42■■■■■ 4.86
SAMD9Q5K651 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC45.41■■■■■ 4.86
SAMD9Q5K651 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC45.41■■■■■ 4.86
SAMD9Q5K651 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC45.36■■■■■ 4.85
SAMD9Q5K651 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC45.36■■■■■ 4.85
SAMD9Q5K651 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.35■■■■■ 4.85
SAMD9Q5K651 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.33■■■■■ 4.85
SAMD9Q5K651 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
SAMD9Q5K651 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.33■■■■■ 4.85
SAMD9Q5K651 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC45.33■■■■■ 4.85
SAMD9Q5K651 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.32■■■■■ 4.85
SAMD9Q5K651 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.31■■■■■ 4.84
SAMD9Q5K651 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC45.31■■■■■ 4.84
SAMD9Q5K651 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC45.3■■■■■ 4.84
SAMD9Q5K651 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC45.29■■■■■ 4.84
SAMD9Q5K651 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC45.28■■■■■ 4.84
SAMD9Q5K651 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.28■■■■■ 4.84
SAMD9Q5K651 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.25■■■■■ 4.83
SAMD9Q5K651 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
SAMD9Q5K651 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.24■■■■■ 4.83
SAMD9Q5K651 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.23■■■■■ 4.83
SAMD9Q5K651 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC45.2■■■■■ 4.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms