Protein–RNA interactions for Protein: Q2PPJ7

RALGAPA2, Ral GTPase-activating protein subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGAPA2Q2PPJ7 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.18■■■■□ 3.54
RALGAPA2Q2PPJ7 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.97■■■■□ 3.51
RALGAPA2Q2PPJ7 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.44
RALGAPA2Q2PPJ7 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
RALGAPA2Q2PPJ7 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
RALGAPA2Q2PPJ7 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
RALGAPA2Q2PPJ7 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
RALGAPA2Q2PPJ7 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
RALGAPA2Q2PPJ7 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
RALGAPA2Q2PPJ7 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
RALGAPA2Q2PPJ7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
RALGAPA2Q2PPJ7 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
RALGAPA2Q2PPJ7 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
RALGAPA2Q2PPJ7 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.2■■■■□ 3.23
RALGAPA2Q2PPJ7 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
RALGAPA2Q2PPJ7 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
RALGAPA2Q2PPJ7 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
RALGAPA2Q2PPJ7 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
RALGAPA2Q2PPJ7 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
RALGAPA2Q2PPJ7 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
RALGAPA2Q2PPJ7 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
RALGAPA2Q2PPJ7 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
RALGAPA2Q2PPJ7 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
RALGAPA2Q2PPJ7 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
RALGAPA2Q2PPJ7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
RALGAPA2Q2PPJ7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
RALGAPA2Q2PPJ7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
RALGAPA2Q2PPJ7 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
RALGAPA2Q2PPJ7 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RALGAPA2Q2PPJ7 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
RALGAPA2Q2PPJ7 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
RALGAPA2Q2PPJ7 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
RALGAPA2Q2PPJ7 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
RALGAPA2Q2PPJ7 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
RALGAPA2Q2PPJ7 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
RALGAPA2Q2PPJ7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.73■■■□□ 2.99
RALGAPA2Q2PPJ7 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
RALGAPA2Q2PPJ7 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
RALGAPA2Q2PPJ7 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.65■■■□□ 2.98
RALGAPA2Q2PPJ7 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
RALGAPA2Q2PPJ7 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
RALGAPA2Q2PPJ7 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
RALGAPA2Q2PPJ7 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
RALGAPA2Q2PPJ7 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
RALGAPA2Q2PPJ7 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
RALGAPA2Q2PPJ7 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
RALGAPA2Q2PPJ7 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
RALGAPA2Q2PPJ7 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
RALGAPA2Q2PPJ7 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
RALGAPA2Q2PPJ7 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
RALGAPA2Q2PPJ7 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
RALGAPA2Q2PPJ7 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
RALGAPA2Q2PPJ7 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
RALGAPA2Q2PPJ7 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
RALGAPA2Q2PPJ7 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
RALGAPA2Q2PPJ7 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
RALGAPA2Q2PPJ7 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
RALGAPA2Q2PPJ7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
RALGAPA2Q2PPJ7 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
RALGAPA2Q2PPJ7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
RALGAPA2Q2PPJ7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
RALGAPA2Q2PPJ7 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
RALGAPA2Q2PPJ7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
RALGAPA2Q2PPJ7 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
RALGAPA2Q2PPJ7 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
RALGAPA2Q2PPJ7 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
RALGAPA2Q2PPJ7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
RALGAPA2Q2PPJ7 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
RALGAPA2Q2PPJ7 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
RALGAPA2Q2PPJ7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
RALGAPA2Q2PPJ7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
RALGAPA2Q2PPJ7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
RALGAPA2Q2PPJ7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
RALGAPA2Q2PPJ7 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
RALGAPA2Q2PPJ7 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
RALGAPA2Q2PPJ7 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
RALGAPA2Q2PPJ7 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
RALGAPA2Q2PPJ7 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
RALGAPA2Q2PPJ7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
RALGAPA2Q2PPJ7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
RALGAPA2Q2PPJ7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
RALGAPA2Q2PPJ7 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
RALGAPA2Q2PPJ7 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
RALGAPA2Q2PPJ7 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
RALGAPA2Q2PPJ7 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
RALGAPA2Q2PPJ7 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
RALGAPA2Q2PPJ7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
RALGAPA2Q2PPJ7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
RALGAPA2Q2PPJ7 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
RALGAPA2Q2PPJ7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
RALGAPA2Q2PPJ7 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
RALGAPA2Q2PPJ7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RALGAPA2Q2PPJ7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
RALGAPA2Q2PPJ7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
RALGAPA2Q2PPJ7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
RALGAPA2Q2PPJ7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32■■■□□ 2.71
RALGAPA2Q2PPJ7 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
RALGAPA2Q2PPJ7 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
RALGAPA2Q2PPJ7 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
RALGAPA2Q2PPJ7 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms