Protein–RNA interactions for Protein: Q16790

CA9, Carbonic anhydrase 9, humanhuman

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA9Q16790 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.33■■■■□ 3.25
CA9Q16790 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
CA9Q16790 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
CA9Q16790 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CA9Q16790 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CA9Q16790 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
CA9Q16790 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
CA9Q16790 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CA9Q16790 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
CA9Q16790 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
CA9Q16790 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
CA9Q16790 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CA9Q16790 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CA9Q16790 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CA9Q16790 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CA9Q16790 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CA9Q16790 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CA9Q16790 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
CA9Q16790 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CA9Q16790 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CA9Q16790 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CA9Q16790 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CA9Q16790 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CA9Q16790 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CA9Q16790 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CA9Q16790 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CA9Q16790 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CA9Q16790 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CA9Q16790 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CA9Q16790 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CA9Q16790 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
CA9Q16790 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
CA9Q16790 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CA9Q16790 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CA9Q16790 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
CA9Q16790 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CA9Q16790 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.61■■■□□ 2.65
CA9Q16790 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
CA9Q16790 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.54■■■□□ 2.64
CA9Q16790 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CA9Q16790 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CA9Q16790 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CA9Q16790 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CA9Q16790 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CA9Q16790 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
CA9Q16790 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CA9Q16790 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CA9Q16790 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CA9Q16790 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CA9Q16790 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
CA9Q16790 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
CA9Q16790 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
CA9Q16790 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
CA9Q16790 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
CA9Q16790 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
CA9Q16790 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CA9Q16790 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CA9Q16790 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CA9Q16790 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CA9Q16790 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CA9Q16790 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
CA9Q16790 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
CA9Q16790 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
CA9Q16790 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
CA9Q16790 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
CA9Q16790 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
CA9Q16790 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
CA9Q16790 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
CA9Q16790 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
CA9Q16790 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
CA9Q16790 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
CA9Q16790 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
CA9Q16790 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
CA9Q16790 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.49■■■□□ 2.47
CA9Q16790 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
CA9Q16790 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
CA9Q16790 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
CA9Q16790 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
CA9Q16790 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
CA9Q16790 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
CA9Q16790 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
CA9Q16790 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
CA9Q16790 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
CA9Q16790 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
CA9Q16790 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
CA9Q16790 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
CA9Q16790 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
CA9Q16790 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
CA9Q16790 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
CA9Q16790 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
CA9Q16790 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.17■■■□□ 2.42
CA9Q16790 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
CA9Q16790 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
CA9Q16790 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
CA9Q16790 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
CA9Q16790 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
CA9Q16790 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
CA9Q16790 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.03■■■□□ 2.4
CA9Q16790 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.98■■■□□ 2.39
CA9Q16790 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
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