Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
ZFHX3Q15911 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
ZFHX3Q15911 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ZFHX3Q15911 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ZFHX3Q15911 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ZFHX3Q15911 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ZFHX3Q15911 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
ZFHX3Q15911 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
ZFHX3Q15911 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZFHX3Q15911 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZFHX3Q15911 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZFHX3Q15911 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZFHX3Q15911 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZFHX3Q15911 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZFHX3Q15911 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZFHX3Q15911 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZFHX3Q15911 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
ZFHX3Q15911 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
ZFHX3Q15911 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
ZFHX3Q15911 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZFHX3Q15911 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZFHX3Q15911 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZFHX3Q15911 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ZFHX3Q15911 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ZFHX3Q15911 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZFHX3Q15911 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ZFHX3Q15911 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ZFHX3Q15911 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ZFHX3Q15911 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ZFHX3Q15911 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ZFHX3Q15911 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ZFHX3Q15911 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
ZFHX3Q15911 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ZFHX3Q15911 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
ZFHX3Q15911 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
ZFHX3Q15911 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
ZFHX3Q15911 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZFHX3Q15911 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ZFHX3Q15911 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ZFHX3Q15911 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ZFHX3Q15911 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ZFHX3Q15911 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZFHX3Q15911 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZFHX3Q15911 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZFHX3Q15911 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZFHX3Q15911 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ZFHX3Q15911 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZFHX3Q15911 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZFHX3Q15911 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZFHX3Q15911 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZFHX3Q15911 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZFHX3Q15911 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZFHX3Q15911 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZFHX3Q15911 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZFHX3Q15911 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZFHX3Q15911 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZFHX3Q15911 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZFHX3Q15911 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZFHX3Q15911 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZFHX3Q15911 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZFHX3Q15911 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZFHX3Q15911 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZFHX3Q15911 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZFHX3Q15911 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZFHX3Q15911 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZFHX3Q15911 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZFHX3Q15911 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ZFHX3Q15911 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZFHX3Q15911 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZFHX3Q15911 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZFHX3Q15911 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZFHX3Q15911 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZFHX3Q15911 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZFHX3Q15911 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZFHX3Q15911 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZFHX3Q15911 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZFHX3Q15911 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZFHX3Q15911 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZFHX3Q15911 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZFHX3Q15911 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZFHX3Q15911 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZFHX3Q15911 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZFHX3Q15911 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZFHX3Q15911 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZFHX3Q15911 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZFHX3Q15911 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZFHX3Q15911 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ZFHX3Q15911 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZFHX3Q15911 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZFHX3Q15911 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZFHX3Q15911 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ZFHX3Q15911 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZFHX3Q15911 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ZFHX3Q15911 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
ZFHX3Q15911 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ZFHX3Q15911 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ZFHX3Q15911 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ZFHX3Q15911 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ZFHX3Q15911 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ZFHX3Q15911 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
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