Protein–RNA interactions for Protein: Q15652

JMJD1C, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 2,540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1CQ15652 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
JMJD1CQ15652 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
JMJD1CQ15652 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
JMJD1CQ15652 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
JMJD1CQ15652 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
JMJD1CQ15652 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
JMJD1CQ15652 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
JMJD1CQ15652 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.92
JMJD1CQ15652 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
JMJD1CQ15652 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
JMJD1CQ15652 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
JMJD1CQ15652 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
JMJD1CQ15652 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
JMJD1CQ15652 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
JMJD1CQ15652 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
JMJD1CQ15652 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
JMJD1CQ15652 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
JMJD1CQ15652 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
JMJD1CQ15652 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
JMJD1CQ15652 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
JMJD1CQ15652 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
JMJD1CQ15652 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
JMJD1CQ15652 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
JMJD1CQ15652 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
JMJD1CQ15652 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
JMJD1CQ15652 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
JMJD1CQ15652 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
JMJD1CQ15652 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
JMJD1CQ15652 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
JMJD1CQ15652 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
JMJD1CQ15652 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
JMJD1CQ15652 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
JMJD1CQ15652 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
JMJD1CQ15652 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
JMJD1CQ15652 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
JMJD1CQ15652 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
JMJD1CQ15652 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
JMJD1CQ15652 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
JMJD1CQ15652 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
JMJD1CQ15652 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
JMJD1CQ15652 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
JMJD1CQ15652 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
JMJD1CQ15652 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
JMJD1CQ15652 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
JMJD1CQ15652 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
JMJD1CQ15652 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
JMJD1CQ15652 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
JMJD1CQ15652 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
JMJD1CQ15652 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
JMJD1CQ15652 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
JMJD1CQ15652 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
JMJD1CQ15652 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
JMJD1CQ15652 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
JMJD1CQ15652 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
JMJD1CQ15652 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
JMJD1CQ15652 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
JMJD1CQ15652 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
JMJD1CQ15652 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
JMJD1CQ15652 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
JMJD1CQ15652 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
JMJD1CQ15652 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
JMJD1CQ15652 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
JMJD1CQ15652 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
JMJD1CQ15652 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
JMJD1CQ15652 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
JMJD1CQ15652 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
JMJD1CQ15652 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
JMJD1CQ15652 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
JMJD1CQ15652 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
JMJD1CQ15652 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
JMJD1CQ15652 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
JMJD1CQ15652 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
JMJD1CQ15652 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
JMJD1CQ15652 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
JMJD1CQ15652 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
JMJD1CQ15652 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
JMJD1CQ15652 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
JMJD1CQ15652 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
JMJD1CQ15652 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
JMJD1CQ15652 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
JMJD1CQ15652 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
JMJD1CQ15652 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
JMJD1CQ15652 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
JMJD1CQ15652 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
JMJD1CQ15652 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
JMJD1CQ15652 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
JMJD1CQ15652 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
JMJD1CQ15652 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
JMJD1CQ15652 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
JMJD1CQ15652 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
JMJD1CQ15652 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
JMJD1CQ15652 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
JMJD1CQ15652 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
JMJD1CQ15652 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
JMJD1CQ15652 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
JMJD1CQ15652 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
JMJD1CQ15652 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
JMJD1CQ15652 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
JMJD1CQ15652 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
JMJD1CQ15652 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
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