Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.96■■■□□ 2.87
PCM1Q15154 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PCM1Q15154 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
PCM1Q15154 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PCM1Q15154 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
PCM1Q15154 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
PCM1Q15154 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
PCM1Q15154 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
PCM1Q15154 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.45■■■□□ 2.63
PCM1Q15154 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
PCM1Q15154 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
PCM1Q15154 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PCM1Q15154 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PCM1Q15154 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
PCM1Q15154 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PCM1Q15154 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PCM1Q15154 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PCM1Q15154 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PCM1Q15154 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PCM1Q15154 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PCM1Q15154 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PCM1Q15154 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PCM1Q15154 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC30.2■■■□□ 2.43
PCM1Q15154 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
PCM1Q15154 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PCM1Q15154 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PCM1Q15154 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PCM1Q15154 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PCM1Q15154 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PCM1Q15154 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PCM1Q15154 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PCM1Q15154 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PCM1Q15154 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PCM1Q15154 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PCM1Q15154 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PCM1Q15154 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
PCM1Q15154 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PCM1Q15154 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PCM1Q15154 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PCM1Q15154 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PCM1Q15154 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PCM1Q15154 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PCM1Q15154 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PCM1Q15154 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
PCM1Q15154 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PCM1Q15154 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PCM1Q15154 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PCM1Q15154 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PCM1Q15154 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PCM1Q15154 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PCM1Q15154 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PCM1Q15154 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PCM1Q15154 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PCM1Q15154 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
PCM1Q15154 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
PCM1Q15154 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PCM1Q15154 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PCM1Q15154 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PCM1Q15154 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PCM1Q15154 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PCM1Q15154 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PCM1Q15154 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PCM1Q15154 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PCM1Q15154 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCM1Q15154 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PCM1Q15154 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PCM1Q15154 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PCM1Q15154 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PCM1Q15154 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCM1Q15154 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PCM1Q15154 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PCM1Q15154 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PCM1Q15154 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCM1Q15154 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PCM1Q15154 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PCM1Q15154 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PCM1Q15154 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PCM1Q15154 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PCM1Q15154 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PCM1Q15154 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCM1Q15154 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PCM1Q15154 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCM1Q15154 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PCM1Q15154 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PCM1Q15154 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PCM1Q15154 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PCM1Q15154 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
PCM1Q15154 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PCM1Q15154 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PCM1Q15154 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PCM1Q15154 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PCM1Q15154 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PCM1Q15154 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PCM1Q15154 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PCM1Q15154 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCM1Q15154 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PCM1Q15154 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCM1Q15154 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PCM1Q15154 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCM1Q15154 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
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