Protein–RNA interactions for Protein: Q14135

VGLL4, Transcription cofactor vestigial-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL4Q14135 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC40.91■■■■■ 4.14
VGLL4Q14135 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC40.53■■■■■ 4.08
VGLL4Q14135 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.96■■■■□ 3.99
VGLL4Q14135 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
VGLL4Q14135 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
VGLL4Q14135 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.3■■■■□ 3.88
VGLL4Q14135 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.12■■■■□ 3.85
VGLL4Q14135 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.98■■■■□ 3.83
VGLL4Q14135 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.82■■■■□ 3.8
VGLL4Q14135 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC38.65■■■■□ 3.78
VGLL4Q14135 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.51■■■■□ 3.76
VGLL4Q14135 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC38.49■■■■□ 3.75
VGLL4Q14135 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC38.47■■■■□ 3.75
VGLL4Q14135 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
VGLL4Q14135 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.12■■■■□ 3.69
VGLL4Q14135 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
VGLL4Q14135 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
VGLL4Q14135 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
VGLL4Q14135 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
VGLL4Q14135 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
VGLL4Q14135 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
VGLL4Q14135 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
VGLL4Q14135 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.6
VGLL4Q14135 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
VGLL4Q14135 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
VGLL4Q14135 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
VGLL4Q14135 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
VGLL4Q14135 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
VGLL4Q14135 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
VGLL4Q14135 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
VGLL4Q14135 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
VGLL4Q14135 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
VGLL4Q14135 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
VGLL4Q14135 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC36.89■■■■□ 3.5
VGLL4Q14135 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
VGLL4Q14135 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
VGLL4Q14135 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
VGLL4Q14135 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
VGLL4Q14135 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
VGLL4Q14135 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
VGLL4Q14135 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC36.42■■■■□ 3.42
VGLL4Q14135 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
VGLL4Q14135 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
VGLL4Q14135 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
VGLL4Q14135 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
VGLL4Q14135 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC35.98■■■■□ 3.35
VGLL4Q14135 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
VGLL4Q14135 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC35.96■■■■□ 3.35
VGLL4Q14135 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
VGLL4Q14135 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
VGLL4Q14135 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.76■■■■□ 3.32
VGLL4Q14135 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
VGLL4Q14135 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
VGLL4Q14135 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC35.72■■■■□ 3.31
VGLL4Q14135 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
VGLL4Q14135 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC35.7■■■■□ 3.31
VGLL4Q14135 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
VGLL4Q14135 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.69■■■■□ 3.3
VGLL4Q14135 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
VGLL4Q14135 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
VGLL4Q14135 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
VGLL4Q14135 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
VGLL4Q14135 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
VGLL4Q14135 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC35.52■■■■□ 3.28
VGLL4Q14135 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
VGLL4Q14135 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
VGLL4Q14135 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
VGLL4Q14135 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
VGLL4Q14135 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
VGLL4Q14135 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
VGLL4Q14135 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
VGLL4Q14135 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
VGLL4Q14135 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
VGLL4Q14135 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
VGLL4Q14135 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
VGLL4Q14135 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
VGLL4Q14135 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
VGLL4Q14135 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
VGLL4Q14135 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC35.19■■■■□ 3.22
VGLL4Q14135 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
VGLL4Q14135 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
VGLL4Q14135 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC35.15■■■■□ 3.22
VGLL4Q14135 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
VGLL4Q14135 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
VGLL4Q14135 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
VGLL4Q14135 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
VGLL4Q14135 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC34.99■■■■□ 3.19
VGLL4Q14135 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
VGLL4Q14135 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
VGLL4Q14135 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
VGLL4Q14135 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
VGLL4Q14135 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
VGLL4Q14135 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
VGLL4Q14135 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
VGLL4Q14135 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.84■■■■□ 3.17
VGLL4Q14135 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
VGLL4Q14135 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
VGLL4Q14135 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
VGLL4Q14135 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC34.75■■■■□ 3.15
VGLL4Q14135 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
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