Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.18■■■■□ 3.86
TRIM29Q14134 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.02■■■■□ 3.84
TRIM29Q14134 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.38■■■■□ 3.74
TRIM29Q14134 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
TRIM29Q14134 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.05■■■■□ 3.68
TRIM29Q14134 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
TRIM29Q14134 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
TRIM29Q14134 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
TRIM29Q14134 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37.66■■■■□ 3.62
TRIM29Q14134 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
TRIM29Q14134 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
TRIM29Q14134 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
TRIM29Q14134 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
TRIM29Q14134 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
TRIM29Q14134 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
TRIM29Q14134 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.7■■■■□ 3.47
TRIM29Q14134 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
TRIM29Q14134 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
TRIM29Q14134 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
TRIM29Q14134 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
TRIM29Q14134 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36.13■■■■□ 3.37
TRIM29Q14134 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
TRIM29Q14134 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.34
TRIM29Q14134 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
TRIM29Q14134 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.92■■■■□ 3.34
TRIM29Q14134 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
TRIM29Q14134 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
TRIM29Q14134 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.87■■■■□ 3.33
TRIM29Q14134 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
TRIM29Q14134 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
TRIM29Q14134 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.58■■■■□ 3.29
TRIM29Q14134 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
TRIM29Q14134 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
TRIM29Q14134 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
TRIM29Q14134 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
TRIM29Q14134 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
TRIM29Q14134 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.25■■■■□ 3.23
TRIM29Q14134 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
TRIM29Q14134 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
TRIM29Q14134 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
TRIM29Q14134 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.06■■■■□ 3.2
TRIM29Q14134 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
TRIM29Q14134 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
TRIM29Q14134 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
TRIM29Q14134 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
TRIM29Q14134 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
TRIM29Q14134 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
TRIM29Q14134 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
TRIM29Q14134 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
TRIM29Q14134 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
TRIM29Q14134 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
TRIM29Q14134 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
TRIM29Q14134 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
TRIM29Q14134 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TRIM29Q14134 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
TRIM29Q14134 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
TRIM29Q14134 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TRIM29Q14134 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TRIM29Q14134 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
TRIM29Q14134 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
TRIM29Q14134 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TRIM29Q14134 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
TRIM29Q14134 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TRIM29Q14134 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
TRIM29Q14134 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
TRIM29Q14134 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
TRIM29Q14134 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TRIM29Q14134 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
TRIM29Q14134 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
TRIM29Q14134 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
TRIM29Q14134 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
TRIM29Q14134 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
TRIM29Q14134 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
TRIM29Q14134 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRIM29Q14134 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
TRIM29Q14134 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
TRIM29Q14134 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
TRIM29Q14134 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
TRIM29Q14134 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
TRIM29Q14134 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
TRIM29Q14134 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
TRIM29Q14134 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
TRIM29Q14134 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.63■■■□□ 2.97
TRIM29Q14134 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
TRIM29Q14134 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
TRIM29Q14134 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
TRIM29Q14134 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
TRIM29Q14134 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
TRIM29Q14134 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRIM29Q14134 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRIM29Q14134 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
TRIM29Q14134 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
TRIM29Q14134 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
TRIM29Q14134 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
TRIM29Q14134 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
TRIM29Q14134 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
TRIM29Q14134 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.36■■■□□ 2.93
TRIM29Q14134 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRIM29Q14134 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
TRIM29Q14134 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
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