Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
PDE1CQ14123 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PDE1CQ14123 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PDE1CQ14123 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PDE1CQ14123 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PDE1CQ14123 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
PDE1CQ14123 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PDE1CQ14123 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
PDE1CQ14123 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
PDE1CQ14123 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PDE1CQ14123 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
PDE1CQ14123 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
PDE1CQ14123 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PDE1CQ14123 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PDE1CQ14123 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
PDE1CQ14123 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
PDE1CQ14123 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PDE1CQ14123 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
PDE1CQ14123 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
PDE1CQ14123 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
PDE1CQ14123 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.77■■■□□ 2.68
PDE1CQ14123 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
PDE1CQ14123 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
PDE1CQ14123 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
PDE1CQ14123 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
PDE1CQ14123 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.5■■■□□ 2.63
PDE1CQ14123 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PDE1CQ14123 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
PDE1CQ14123 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PDE1CQ14123 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
PDE1CQ14123 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PDE1CQ14123 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PDE1CQ14123 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PDE1CQ14123 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
PDE1CQ14123 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PDE1CQ14123 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PDE1CQ14123 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PDE1CQ14123 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PDE1CQ14123 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
PDE1CQ14123 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PDE1CQ14123 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PDE1CQ14123 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PDE1CQ14123 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
PDE1CQ14123 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PDE1CQ14123 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PDE1CQ14123 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
PDE1CQ14123 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
PDE1CQ14123 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PDE1CQ14123 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
PDE1CQ14123 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
PDE1CQ14123 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PDE1CQ14123 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PDE1CQ14123 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PDE1CQ14123 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PDE1CQ14123 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
PDE1CQ14123 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
PDE1CQ14123 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
PDE1CQ14123 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
PDE1CQ14123 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PDE1CQ14123 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
PDE1CQ14123 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
PDE1CQ14123 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
PDE1CQ14123 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.14■■■□□ 2.42
PDE1CQ14123 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PDE1CQ14123 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PDE1CQ14123 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PDE1CQ14123 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
PDE1CQ14123 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PDE1CQ14123 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PDE1CQ14123 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDE1CQ14123 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PDE1CQ14123 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PDE1CQ14123 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PDE1CQ14123 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDE1CQ14123 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDE1CQ14123 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDE1CQ14123 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PDE1CQ14123 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PDE1CQ14123 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PDE1CQ14123 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PDE1CQ14123 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PDE1CQ14123 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PDE1CQ14123 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PDE1CQ14123 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PDE1CQ14123 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDE1CQ14123 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDE1CQ14123 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
PDE1CQ14123 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PDE1CQ14123 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PDE1CQ14123 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PDE1CQ14123 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PDE1CQ14123 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PDE1CQ14123 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PDE1CQ14123 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PDE1CQ14123 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
PDE1CQ14123 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDE1CQ14123 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PDE1CQ14123 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PDE1CQ14123 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PDE1CQ14123 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
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