Protein–RNA interactions for Protein: Q14003

KCNC3, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 3, humanhuman

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Length 757 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC3Q14003 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC36.71■■■■□ 3.47
KCNC3Q14003 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.46■■■■□ 3.43
KCNC3Q14003 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.95■■■■□ 3.35
KCNC3Q14003 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
KCNC3Q14003 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
KCNC3Q14003 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.21■■■■□ 3.23
KCNC3Q14003 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
KCNC3Q14003 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
KCNC3Q14003 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
KCNC3Q14003 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
KCNC3Q14003 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
KCNC3Q14003 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
KCNC3Q14003 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
KCNC3Q14003 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
KCNC3Q14003 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
KCNC3Q14003 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
KCNC3Q14003 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
KCNC3Q14003 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
KCNC3Q14003 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
KCNC3Q14003 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
KCNC3Q14003 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
KCNC3Q14003 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
KCNC3Q14003 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
KCNC3Q14003 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
KCNC3Q14003 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
KCNC3Q14003 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
KCNC3Q14003 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
KCNC3Q14003 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
KCNC3Q14003 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
KCNC3Q14003 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
KCNC3Q14003 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
KCNC3Q14003 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
KCNC3Q14003 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
KCNC3Q14003 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
KCNC3Q14003 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
KCNC3Q14003 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
KCNC3Q14003 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
KCNC3Q14003 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
KCNC3Q14003 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
KCNC3Q14003 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
KCNC3Q14003 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
KCNC3Q14003 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
KCNC3Q14003 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
KCNC3Q14003 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
KCNC3Q14003 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
KCNC3Q14003 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
KCNC3Q14003 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
KCNC3Q14003 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
KCNC3Q14003 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
KCNC3Q14003 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
KCNC3Q14003 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
KCNC3Q14003 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
KCNC3Q14003 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
KCNC3Q14003 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
KCNC3Q14003 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
KCNC3Q14003 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
KCNC3Q14003 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
KCNC3Q14003 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
KCNC3Q14003 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32■■■□□ 2.71
KCNC3Q14003 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
KCNC3Q14003 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
KCNC3Q14003 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
KCNC3Q14003 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.89■■■□□ 2.7
KCNC3Q14003 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
KCNC3Q14003 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
KCNC3Q14003 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
KCNC3Q14003 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
KCNC3Q14003 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.74■■■□□ 2.67
KCNC3Q14003 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
KCNC3Q14003 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
KCNC3Q14003 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
KCNC3Q14003 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
KCNC3Q14003 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.61■■■□□ 2.65
KCNC3Q14003 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
KCNC3Q14003 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
KCNC3Q14003 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.6■■■□□ 2.65
KCNC3Q14003 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
KCNC3Q14003 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
KCNC3Q14003 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
KCNC3Q14003 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
KCNC3Q14003 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
KCNC3Q14003 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
KCNC3Q14003 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
KCNC3Q14003 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC31.48■■■□□ 2.63
KCNC3Q14003 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
KCNC3Q14003 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
KCNC3Q14003 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
KCNC3Q14003 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
KCNC3Q14003 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
KCNC3Q14003 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
KCNC3Q14003 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
KCNC3Q14003 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
KCNC3Q14003 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
KCNC3Q14003 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
KCNC3Q14003 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
KCNC3Q14003 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
KCNC3Q14003 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
KCNC3Q14003 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
KCNC3Q14003 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
KCNC3Q14003 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
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