Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATRQ13535 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ATRQ13535 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ATRQ13535 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATRQ13535 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATRQ13535 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ATRQ13535 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ATRQ13535 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ATRQ13535 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ATRQ13535 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATRQ13535 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATRQ13535 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATRQ13535 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATRQ13535 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATRQ13535 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ATRQ13535 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATRQ13535 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATRQ13535 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ATRQ13535 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
ATRQ13535 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATRQ13535 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ATRQ13535 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ATRQ13535 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
ATRQ13535 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATRQ13535 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ATRQ13535 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATRQ13535 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATRQ13535 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ATRQ13535 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATRQ13535 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATRQ13535 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATRQ13535 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATRQ13535 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATRQ13535 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATRQ13535 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATRQ13535 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATRQ13535 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ATRQ13535 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
ATRQ13535 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATRQ13535 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ATRQ13535 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
ATRQ13535 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ATRQ13535 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ATRQ13535 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATRQ13535 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATRQ13535 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ATRQ13535 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ATRQ13535 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATRQ13535 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATRQ13535 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATRQ13535 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATRQ13535 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATRQ13535 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATRQ13535 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATRQ13535 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATRQ13535 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATRQ13535 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATRQ13535 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATRQ13535 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATRQ13535 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATRQ13535 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATRQ13535 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATRQ13535 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATRQ13535 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATRQ13535 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATRQ13535 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATRQ13535 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATRQ13535 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATRQ13535 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATRQ13535 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATRQ13535 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATRQ13535 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATRQ13535 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATRQ13535 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATRQ13535 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATRQ13535 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATRQ13535 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATRQ13535 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATRQ13535 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ATRQ13535 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATRQ13535 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATRQ13535 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATRQ13535 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ATRQ13535 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATRQ13535 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATRQ13535 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATRQ13535 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATRQ13535 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATRQ13535 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATRQ13535 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ATRQ13535 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATRQ13535 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATRQ13535 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATRQ13535 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATRQ13535 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATRQ13535 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATRQ13535 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATRQ13535 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATRQ13535 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATRQ13535 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
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