Protein–RNA interactions for Protein: Q13487

SNAPC2, snRNA-activating protein complex subunit 2, humanhuman

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC2Q13487 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC40.57■■■■■ 4.09
SNAPC2Q13487 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC40.3■■■■■ 4.04
SNAPC2Q13487 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.73■■■■□ 3.95
SNAPC2Q13487 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
SNAPC2Q13487 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
SNAPC2Q13487 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.96■■■■□ 3.83
SNAPC2Q13487 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
SNAPC2Q13487 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.62■■■■□ 3.77
SNAPC2Q13487 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.58■■■■□ 3.77
SNAPC2Q13487 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC38.43■■■■□ 3.74
SNAPC2Q13487 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
SNAPC2Q13487 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC38.18■■■■□ 3.7
SNAPC2Q13487 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC38.18■■■■□ 3.7
SNAPC2Q13487 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
SNAPC2Q13487 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
SNAPC2Q13487 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
SNAPC2Q13487 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
SNAPC2Q13487 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
SNAPC2Q13487 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
SNAPC2Q13487 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
SNAPC2Q13487 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC37.35■■■■□ 3.57
SNAPC2Q13487 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC37.29■■■■□ 3.56
SNAPC2Q13487 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
SNAPC2Q13487 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
SNAPC2Q13487 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
SNAPC2Q13487 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.14■■■■□ 3.54
SNAPC2Q13487 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SNAPC2Q13487 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
SNAPC2Q13487 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37■■■■□ 3.51
SNAPC2Q13487 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
SNAPC2Q13487 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
SNAPC2Q13487 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
SNAPC2Q13487 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
SNAPC2Q13487 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC36.71■■■■□ 3.47
SNAPC2Q13487 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
SNAPC2Q13487 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
SNAPC2Q13487 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
SNAPC2Q13487 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SNAPC2Q13487 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
SNAPC2Q13487 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
SNAPC2Q13487 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
SNAPC2Q13487 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
SNAPC2Q13487 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC35.86■■■■□ 3.33
SNAPC2Q13487 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.83■■■■□ 3.33
SNAPC2Q13487 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
SNAPC2Q13487 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC35.78■■■■□ 3.32
SNAPC2Q13487 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
SNAPC2Q13487 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
SNAPC2Q13487 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
SNAPC2Q13487 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
SNAPC2Q13487 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
SNAPC2Q13487 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
SNAPC2Q13487 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
SNAPC2Q13487 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
SNAPC2Q13487 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
SNAPC2Q13487 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
SNAPC2Q13487 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SNAPC2Q13487 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
SNAPC2Q13487 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.26
SNAPC2Q13487 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
SNAPC2Q13487 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
SNAPC2Q13487 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC35.31■■■■□ 3.24
SNAPC2Q13487 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
SNAPC2Q13487 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
SNAPC2Q13487 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
SNAPC2Q13487 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC35.15■■■■□ 3.22
SNAPC2Q13487 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
SNAPC2Q13487 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.21
SNAPC2Q13487 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
SNAPC2Q13487 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
SNAPC2Q13487 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.08■■■■□ 3.21
SNAPC2Q13487 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
SNAPC2Q13487 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
SNAPC2Q13487 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
SNAPC2Q13487 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SNAPC2Q13487 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
SNAPC2Q13487 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
SNAPC2Q13487 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC34.93■■■■□ 3.18
SNAPC2Q13487 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
SNAPC2Q13487 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
SNAPC2Q13487 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
SNAPC2Q13487 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.89■■■■□ 3.18
SNAPC2Q13487 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
SNAPC2Q13487 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
SNAPC2Q13487 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
SNAPC2Q13487 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
SNAPC2Q13487 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
SNAPC2Q13487 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
SNAPC2Q13487 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
SNAPC2Q13487 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
SNAPC2Q13487 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
SNAPC2Q13487 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SNAPC2Q13487 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SNAPC2Q13487 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SNAPC2Q13487 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SNAPC2Q13487 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SNAPC2Q13487 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
SNAPC2Q13487 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
SNAPC2Q13487 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
SNAPC2Q13487 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
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