Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.18■■■■□ 3.7
MKRN4PQ13434 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.46■■■■□ 3.59
MKRN4PQ13434 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
MKRN4PQ13434 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
MKRN4PQ13434 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
MKRN4PQ13434 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.91■■■■□ 3.5
MKRN4PQ13434 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.91■■■■□ 3.5
MKRN4PQ13434 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
MKRN4PQ13434 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
MKRN4PQ13434 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.34
MKRN4PQ13434 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.82■■■■□ 3.32
MKRN4PQ13434 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC35.74■■■■□ 3.31
MKRN4PQ13434 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.61■■■■□ 3.29
MKRN4PQ13434 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
MKRN4PQ13434 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
MKRN4PQ13434 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
MKRN4PQ13434 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
MKRN4PQ13434 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.42■■■■□ 3.26
MKRN4PQ13434 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
MKRN4PQ13434 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
MKRN4PQ13434 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
MKRN4PQ13434 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
MKRN4PQ13434 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
MKRN4PQ13434 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
MKRN4PQ13434 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
MKRN4PQ13434 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
MKRN4PQ13434 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
MKRN4PQ13434 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
MKRN4PQ13434 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
MKRN4PQ13434 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
MKRN4PQ13434 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
MKRN4PQ13434 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
MKRN4PQ13434 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
MKRN4PQ13434 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
MKRN4PQ13434 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
MKRN4PQ13434 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
MKRN4PQ13434 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
MKRN4PQ13434 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
MKRN4PQ13434 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC34.07■■■■□ 3.04
MKRN4PQ13434 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
MKRN4PQ13434 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
MKRN4PQ13434 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
MKRN4PQ13434 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
MKRN4PQ13434 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
MKRN4PQ13434 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
MKRN4PQ13434 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
MKRN4PQ13434 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC33.76■■■■□ 3
MKRN4PQ13434 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
MKRN4PQ13434 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
MKRN4PQ13434 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
MKRN4PQ13434 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
MKRN4PQ13434 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
MKRN4PQ13434 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
MKRN4PQ13434 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
MKRN4PQ13434 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
MKRN4PQ13434 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
MKRN4PQ13434 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
MKRN4PQ13434 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
MKRN4PQ13434 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
MKRN4PQ13434 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
MKRN4PQ13434 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
MKRN4PQ13434 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
MKRN4PQ13434 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
MKRN4PQ13434 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
MKRN4PQ13434 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
MKRN4PQ13434 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
MKRN4PQ13434 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
MKRN4PQ13434 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
MKRN4PQ13434 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
MKRN4PQ13434 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
MKRN4PQ13434 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC32.93■■■□□ 2.86
MKRN4PQ13434 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
MKRN4PQ13434 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
MKRN4PQ13434 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
MKRN4PQ13434 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.85■■■□□ 2.85
MKRN4PQ13434 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
MKRN4PQ13434 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
MKRN4PQ13434 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
MKRN4PQ13434 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC32.82■■■□□ 2.84
MKRN4PQ13434 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
MKRN4PQ13434 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
MKRN4PQ13434 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
MKRN4PQ13434 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
MKRN4PQ13434 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
MKRN4PQ13434 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
MKRN4PQ13434 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
MKRN4PQ13434 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
MKRN4PQ13434 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
MKRN4PQ13434 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
MKRN4PQ13434 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
MKRN4PQ13434 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
MKRN4PQ13434 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.79
MKRN4PQ13434 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
MKRN4PQ13434 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
MKRN4PQ13434 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
MKRN4PQ13434 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
MKRN4PQ13434 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
MKRN4PQ13434 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
MKRN4PQ13434 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
MKRN4PQ13434 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
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