Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC38.64■■■■□ 3.78
PTGDRQ13258 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
PTGDRQ13258 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.81■■■■□ 3.64
PTGDRQ13258 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
PTGDRQ13258 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
PTGDRQ13258 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC37.39■■■■□ 3.58
PTGDRQ13258 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
PTGDRQ13258 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
PTGDRQ13258 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
PTGDRQ13258 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
PTGDRQ13258 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
PTGDRQ13258 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
PTGDRQ13258 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
PTGDRQ13258 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.38
PTGDRQ13258 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.09■■■■□ 3.37
PTGDRQ13258 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
PTGDRQ13258 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.68■■■■□ 3.3
PTGDRQ13258 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
PTGDRQ13258 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
PTGDRQ13258 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
PTGDRQ13258 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC35.5■■■■□ 3.27
PTGDRQ13258 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
PTGDRQ13258 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
PTGDRQ13258 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
PTGDRQ13258 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
PTGDRQ13258 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
PTGDRQ13258 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
PTGDRQ13258 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
PTGDRQ13258 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
PTGDRQ13258 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC35.06■■■■□ 3.2
PTGDRQ13258 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
PTGDRQ13258 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.85■■■■□ 3.17
PTGDRQ13258 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
PTGDRQ13258 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
PTGDRQ13258 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
PTGDRQ13258 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
PTGDRQ13258 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
PTGDRQ13258 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
PTGDRQ13258 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PTGDRQ13258 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC34.51■■■■□ 3.11
PTGDRQ13258 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
PTGDRQ13258 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PTGDRQ13258 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PTGDRQ13258 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PTGDRQ13258 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PTGDRQ13258 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
PTGDRQ13258 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
PTGDRQ13258 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
PTGDRQ13258 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
PTGDRQ13258 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
PTGDRQ13258 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
PTGDRQ13258 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PTGDRQ13258 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
PTGDRQ13258 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
PTGDRQ13258 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
PTGDRQ13258 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
PTGDRQ13258 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
PTGDRQ13258 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
PTGDRQ13258 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
PTGDRQ13258 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
PTGDRQ13258 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
PTGDRQ13258 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
PTGDRQ13258 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
PTGDRQ13258 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
PTGDRQ13258 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
PTGDRQ13258 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
PTGDRQ13258 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PTGDRQ13258 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PTGDRQ13258 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PTGDRQ13258 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PTGDRQ13258 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PTGDRQ13258 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PTGDRQ13258 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PTGDRQ13258 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PTGDRQ13258 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PTGDRQ13258 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PTGDRQ13258 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PTGDRQ13258 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PTGDRQ13258 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PTGDRQ13258 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PTGDRQ13258 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PTGDRQ13258 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PTGDRQ13258 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PTGDRQ13258 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
PTGDRQ13258 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTGDRQ13258 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
PTGDRQ13258 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
PTGDRQ13258 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
PTGDRQ13258 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
PTGDRQ13258 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
PTGDRQ13258 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
PTGDRQ13258 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
PTGDRQ13258 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
PTGDRQ13258 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
PTGDRQ13258 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
PTGDRQ13258 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
PTGDRQ13258 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.88■■■□□ 2.85
PTGDRQ13258 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.87■■■□□ 2.85
PTGDRQ13258 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PTGDRQ13258 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
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