Protein–RNA interactions for Protein: Q13085

ACACA, Acetyl-CoA carboxylase 1, humanhuman

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Length 2,346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACACAQ13085 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.03■■■□□ 2.88
ACACAQ13085 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
ACACAQ13085 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ACACAQ13085 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
ACACAQ13085 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
ACACAQ13085 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ACACAQ13085 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
ACACAQ13085 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
ACACAQ13085 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
ACACAQ13085 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC31.42■■■□□ 2.62
ACACAQ13085 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
ACACAQ13085 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ACACAQ13085 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC31.15■■■□□ 2.58
ACACAQ13085 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ACACAQ13085 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
ACACAQ13085 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
ACACAQ13085 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ACACAQ13085 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ACACAQ13085 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
ACACAQ13085 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
ACACAQ13085 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ACACAQ13085 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
ACACAQ13085 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
ACACAQ13085 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.45
ACACAQ13085 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
ACACAQ13085 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
ACACAQ13085 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
ACACAQ13085 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ACACAQ13085 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ACACAQ13085 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.02■■■□□ 2.4
ACACAQ13085 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ACACAQ13085 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ACACAQ13085 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ACACAQ13085 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
ACACAQ13085 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
ACACAQ13085 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
ACACAQ13085 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
ACACAQ13085 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
ACACAQ13085 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
ACACAQ13085 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ACACAQ13085 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
ACACAQ13085 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ACACAQ13085 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
ACACAQ13085 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
ACACAQ13085 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
ACACAQ13085 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
ACACAQ13085 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
ACACAQ13085 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
ACACAQ13085 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
ACACAQ13085 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
ACACAQ13085 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
ACACAQ13085 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
ACACAQ13085 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
ACACAQ13085 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
ACACAQ13085 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
ACACAQ13085 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
ACACAQ13085 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ACACAQ13085 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
ACACAQ13085 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
ACACAQ13085 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
ACACAQ13085 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
ACACAQ13085 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
ACACAQ13085 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ACACAQ13085 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
ACACAQ13085 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
ACACAQ13085 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
ACACAQ13085 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ACACAQ13085 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ACACAQ13085 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ACACAQ13085 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ACACAQ13085 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
ACACAQ13085 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ACACAQ13085 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ACACAQ13085 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ACACAQ13085 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ACACAQ13085 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ACACAQ13085 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ACACAQ13085 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ACACAQ13085 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ACACAQ13085 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ACACAQ13085 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ACACAQ13085 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ACACAQ13085 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ACACAQ13085 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ACACAQ13085 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ACACAQ13085 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ACACAQ13085 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ACACAQ13085 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ACACAQ13085 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ACACAQ13085 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ACACAQ13085 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ACACAQ13085 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ACACAQ13085 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ACACAQ13085 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
ACACAQ13085 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ACACAQ13085 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
ACACAQ13085 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ACACAQ13085 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ACACAQ13085 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ACACAQ13085 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
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