Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC47.66■■■■■ 5.22
CPSF1Q10570 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC46.73■■■■■ 5.07
CPSF1Q10570 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.4■■■■■ 5.02
CPSF1Q10570 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.1■■■■■ 4.97
CPSF1Q10570 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.08■■■■■ 4.97
CPSF1Q10570 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.97■■■■■ 4.95
CPSF1Q10570 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.96■■■■■ 4.95
CPSF1Q10570 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC45.76■■■■■ 4.92
CPSF1Q10570 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC44.73■■■■■ 4.75
CPSF1Q10570 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC44.66■■■■■ 4.74
CPSF1Q10570 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC44.62■■■■■ 4.73
CPSF1Q10570 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC44.53■■■■■ 4.72
CPSF1Q10570 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC44.49■■■■■ 4.71
CPSF1Q10570 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC44.46■■■■■ 4.71
CPSF1Q10570 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC44.44■■■■■ 4.7
CPSF1Q10570 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC44.15■■■■■ 4.66
CPSF1Q10570 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC44.12■■■■■ 4.65
CPSF1Q10570 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.99■■■■■ 4.63
CPSF1Q10570 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC43.9■■■■■ 4.62
CPSF1Q10570 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.86■■■■■ 4.61
CPSF1Q10570 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.78■■■■■ 4.6
CPSF1Q10570 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC43.78■■■■■ 4.6
CPSF1Q10570 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.71■■■■■ 4.59
CPSF1Q10570 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
CPSF1Q10570 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
CPSF1Q10570 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
CPSF1Q10570 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
CPSF1Q10570 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC43.11■■■■■ 4.49
CPSF1Q10570 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC42.99■■■■■ 4.47
CPSF1Q10570 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
CPSF1Q10570 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC42.81■■■■■ 4.44
CPSF1Q10570 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.8■■■■■ 4.44
CPSF1Q10570 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
CPSF1Q10570 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.56■■■■■ 4.4
CPSF1Q10570 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
CPSF1Q10570 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
CPSF1Q10570 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC42.48■■■■■ 4.39
CPSF1Q10570 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC42.44■■■■■ 4.38
CPSF1Q10570 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC42.38■■■■■ 4.38
CPSF1Q10570 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC42.35■■■■■ 4.37
CPSF1Q10570 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC42.26■■■■■ 4.36
CPSF1Q10570 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
CPSF1Q10570 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
CPSF1Q10570 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC42.16■■■■■ 4.34
CPSF1Q10570 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
CPSF1Q10570 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
CPSF1Q10570 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
CPSF1Q10570 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC41.68■■■■■ 4.26
CPSF1Q10570 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
CPSF1Q10570 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
CPSF1Q10570 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.57■■■■■ 4.24
CPSF1Q10570 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC41.45■■■■■ 4.23
CPSF1Q10570 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC41.4■■■■■ 4.22
CPSF1Q10570 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.35■■■■■ 4.21
CPSF1Q10570 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC41.34■■■■■ 4.21
CPSF1Q10570 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC41.26■■■■■ 4.2
CPSF1Q10570 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC41.25■■■■■ 4.19
CPSF1Q10570 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC41.24■■■■■ 4.19
CPSF1Q10570 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.23■■■■■ 4.19
CPSF1Q10570 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
CPSF1Q10570 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.16■■■■■ 4.18
CPSF1Q10570 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
CPSF1Q10570 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
CPSF1Q10570 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC41.13■■■■■ 4.17
CPSF1Q10570 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC41.1■■■■■ 4.17
CPSF1Q10570 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
CPSF1Q10570 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.06■■■■■ 4.16
CPSF1Q10570 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC41■■■■■ 4.15
CPSF1Q10570 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.93■■■■■ 4.14
CPSF1Q10570 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
CPSF1Q10570 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.9■■■■■ 4.14
CPSF1Q10570 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
CPSF1Q10570 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC40.88■■■■■ 4.13
CPSF1Q10570 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
CPSF1Q10570 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
CPSF1Q10570 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
CPSF1Q10570 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC40.84■■■■■ 4.13
CPSF1Q10570 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.79■■■■■ 4.12
CPSF1Q10570 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC40.76■■■■■ 4.12
CPSF1Q10570 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC40.73■■■■■ 4.11
CPSF1Q10570 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
CPSF1Q10570 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC40.68■■■■■ 4.1
CPSF1Q10570 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.65■■■■■ 4.1
CPSF1Q10570 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
CPSF1Q10570 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
CPSF1Q10570 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC40.57■■■■■ 4.08
CPSF1Q10570 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
CPSF1Q10570 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
CPSF1Q10570 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
CPSF1Q10570 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.51■■■■■ 4.08
CPSF1Q10570 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
CPSF1Q10570 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
CPSF1Q10570 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
CPSF1Q10570 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
CPSF1Q10570 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
CPSF1Q10570 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
CPSF1Q10570 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
CPSF1Q10570 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
CPSF1Q10570 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC40.31■■■■■ 4.04
CPSF1Q10570 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC40.31■■■■■ 4.04
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