Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC59.55■■■■■ 7.12
ABCC8Q09428 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC59.44■■■■■ 7.11
ABCC8Q09428 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC58.74■■■■■ 6.99
ABCC8Q09428 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC58.18■■■■■ 6.9
ABCC8Q09428 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.47■■■■■ 6.79
ABCC8Q09428 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC57.15■■■■■ 6.74
ABCC8Q09428 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC57.14■■■■■ 6.74
ABCC8Q09428 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC56.85■■■■■ 6.69
ABCC8Q09428 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC56.81■■■■■ 6.69
ABCC8Q09428 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC56.67■■■■■ 6.66
ABCC8Q09428 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC56.63■■■■■ 6.66
ABCC8Q09428 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC56.33■■■■■ 6.61
ABCC8Q09428 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC56.29■■■■■ 6.6
ABCC8Q09428 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC56.23■■■■■ 6.59
ABCC8Q09428 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC56.13■■■■■ 6.58
ABCC8Q09428 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC55.88■■■■■ 6.54
ABCC8Q09428 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC55.52■■■■■ 6.48
ABCC8Q09428 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC55.45■■■■■ 6.47
ABCC8Q09428 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC55.36■■■■■ 6.45
ABCC8Q09428 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC55.16■■■■■ 6.42
ABCC8Q09428 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC55.07■■■■■ 6.41
ABCC8Q09428 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.97■■■■■ 6.39
ABCC8Q09428 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC54.97■■■■■ 6.39
ABCC8Q09428 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.85■■■■■ 6.37
ABCC8Q09428 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC54.85■■■■■ 6.37
ABCC8Q09428 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC54.77■■■■■ 6.36
ABCC8Q09428 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC54.75■■■■■ 6.36
ABCC8Q09428 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.74■■■■■ 6.35
ABCC8Q09428 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC54.5■■■■■ 6.32
ABCC8Q09428 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC54.45■■■■■ 6.31
ABCC8Q09428 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC54.43■■■■■ 6.3
ABCC8Q09428 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC54.37■■■■■ 6.29
ABCC8Q09428 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC54.37■■■■■ 6.29
ABCC8Q09428 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC54.34■■■■■ 6.29
ABCC8Q09428 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC54.16■■■■■ 6.26
ABCC8Q09428 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC53.78■■■■■ 6.2
ABCC8Q09428 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC53.69■■■■■ 6.19
ABCC8Q09428 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC53.59■■■■■ 6.17
ABCC8Q09428 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC53.48■■■■■ 6.15
ABCC8Q09428 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC53.3■■■■■ 6.12
ABCC8Q09428 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC53.07■■■■■ 6.09
ABCC8Q09428 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC53.03■■■■■ 6.08
ABCC8Q09428 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC52.93■■■■■ 6.06
ABCC8Q09428 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC52.9■■■■■ 6.06
ABCC8Q09428 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC52.76■■■■■ 6.04
ABCC8Q09428 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC52.65■■■■■ 6.02
ABCC8Q09428 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC52.62■■■■■ 6.01
ABCC8Q09428 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC52.58■■■■■ 6.01
ABCC8Q09428 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC52.57■■■■■ 6.01
ABCC8Q09428 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC52.54■■■■■ 6
ABCC8Q09428 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.47■■■■■ 5.99
ABCC8Q09428 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.42■■■■■ 5.98
ABCC8Q09428 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC52.4■■■■■ 5.98
ABCC8Q09428 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC52.35■■■■■ 5.97
ABCC8Q09428 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC52.34■■■■■ 5.97
ABCC8Q09428 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC52.34■■■■■ 5.97
ABCC8Q09428 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC52.33■■■■■ 5.97
ABCC8Q09428 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC52.29■■■■■ 5.96
ABCC8Q09428 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC52.26■■■■■ 5.96
ABCC8Q09428 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC52.24■■■■■ 5.95
ABCC8Q09428 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC52.22■■■■■ 5.95
ABCC8Q09428 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC52.16■■■■■ 5.94
ABCC8Q09428 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC52.14■■■■■ 5.94
ABCC8Q09428 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC51.95■■■■■ 5.91
ABCC8Q09428 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.9■■■■■ 5.9
ABCC8Q09428 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC51.9■■■■■ 5.9
ABCC8Q09428 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC51.89■■■■■ 5.9
ABCC8Q09428 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC51.86■■■■■ 5.89
ABCC8Q09428 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC51.81■■■■■ 5.88
ABCC8Q09428 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.68■■■■■ 5.86
ABCC8Q09428 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC51.62■■■■■ 5.85
ABCC8Q09428 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC51.57■■■■■ 5.85
ABCC8Q09428 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.56■■■■■ 5.85
ABCC8Q09428 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.56■■■■■ 5.84
ABCC8Q09428 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC51.55■■■■■ 5.84
ABCC8Q09428 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC51.53■■■■■ 5.84
ABCC8Q09428 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC51.47■■■■■ 5.83
ABCC8Q09428 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC51.46■■■■■ 5.83
ABCC8Q09428 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC51.45■■■■■ 5.83
ABCC8Q09428 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC51.44■■■■■ 5.83
ABCC8Q09428 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.42■■■■■ 5.82
ABCC8Q09428 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC51.42■■■■■ 5.82
ABCC8Q09428 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC51.36■■■■■ 5.81
ABCC8Q09428 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC51.34■■■■■ 5.81
ABCC8Q09428 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC51.33■■■■■ 5.81
ABCC8Q09428 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.28■■■■■ 5.8
ABCC8Q09428 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC51.28■■■■■ 5.8
ABCC8Q09428 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.27■■■■■ 5.8
ABCC8Q09428 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.23■■■■■ 5.79
ABCC8Q09428 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC51.19■■■■■ 5.79
ABCC8Q09428 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51.19■■■■■ 5.78
ABCC8Q09428 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC51.17■■■■■ 5.78
ABCC8Q09428 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC51.16■■■■■ 5.78
ABCC8Q09428 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC51.1■■■■■ 5.77
ABCC8Q09428 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC51.06■■■■■ 5.76
ABCC8Q09428 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC51.05■■■■■ 5.76
ABCC8Q09428 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC51.02■■■■■ 5.76
ABCC8Q09428 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC51■■■■■ 5.75
ABCC8Q09428 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC50.98■■■■■ 5.75
ABCC8Q09428 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC50.98■■■■■ 5.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms