Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.95■■■■□ 3.67
CACNB1Q02641 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CACNB1Q02641 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC37.01■■■■□ 3.51
CACNB1Q02641 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
CACNB1Q02641 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
CACNB1Q02641 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CACNB1Q02641 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
CACNB1Q02641 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
CACNB1Q02641 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
CACNB1Q02641 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
CACNB1Q02641 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
CACNB1Q02641 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
CACNB1Q02641 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
CACNB1Q02641 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CACNB1Q02641 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CACNB1Q02641 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
CACNB1Q02641 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC35.07■■■■□ 3.2
CACNB1Q02641 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
CACNB1Q02641 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CACNB1Q02641 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
CACNB1Q02641 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
CACNB1Q02641 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
CACNB1Q02641 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
CACNB1Q02641 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.62■■■■□ 3.13
CACNB1Q02641 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CACNB1Q02641 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CACNB1Q02641 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
CACNB1Q02641 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
CACNB1Q02641 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
CACNB1Q02641 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
CACNB1Q02641 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
CACNB1Q02641 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
CACNB1Q02641 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
CACNB1Q02641 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
CACNB1Q02641 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
CACNB1Q02641 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CACNB1Q02641 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CACNB1Q02641 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
CACNB1Q02641 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CACNB1Q02641 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
CACNB1Q02641 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
CACNB1Q02641 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
CACNB1Q02641 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
CACNB1Q02641 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
CACNB1Q02641 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CACNB1Q02641 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
CACNB1Q02641 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CACNB1Q02641 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CACNB1Q02641 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CACNB1Q02641 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CACNB1Q02641 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
CACNB1Q02641 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CACNB1Q02641 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
CACNB1Q02641 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CACNB1Q02641 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
CACNB1Q02641 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
CACNB1Q02641 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CACNB1Q02641 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
CACNB1Q02641 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CACNB1Q02641 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CACNB1Q02641 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CACNB1Q02641 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CACNB1Q02641 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
CACNB1Q02641 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CACNB1Q02641 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CACNB1Q02641 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
CACNB1Q02641 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CACNB1Q02641 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CACNB1Q02641 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.83■■■□□ 2.85
CACNB1Q02641 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
CACNB1Q02641 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CACNB1Q02641 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CACNB1Q02641 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
CACNB1Q02641 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
CACNB1Q02641 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.83
CACNB1Q02641 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
CACNB1Q02641 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
CACNB1Q02641 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
CACNB1Q02641 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
CACNB1Q02641 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
CACNB1Q02641 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CACNB1Q02641 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
CACNB1Q02641 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
CACNB1Q02641 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CACNB1Q02641 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CACNB1Q02641 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CACNB1Q02641 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
CACNB1Q02641 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CACNB1Q02641 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CACNB1Q02641 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CACNB1Q02641 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CACNB1Q02641 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CACNB1Q02641 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CACNB1Q02641 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CACNB1Q02641 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CACNB1Q02641 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
CACNB1Q02641 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CACNB1Q02641 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CACNB1Q02641 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CACNB1Q02641 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.4 ms