Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CACNB1Q02641 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CACNB1Q02641 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CACNB1Q02641 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CACNB1Q02641 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CACNB1Q02641 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CACNB1Q02641 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CACNB1Q02641 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
CACNB1Q02641 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CACNB1Q02641 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CACNB1Q02641 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CACNB1Q02641 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CACNB1Q02641 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CACNB1Q02641 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
CACNB1Q02641 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
CACNB1Q02641 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
CACNB1Q02641 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CACNB1Q02641 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CACNB1Q02641 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CACNB1Q02641 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CACNB1Q02641 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CACNB1Q02641 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
CACNB1Q02641 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
CACNB1Q02641 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CACNB1Q02641 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
CACNB1Q02641 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
CACNB1Q02641 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
CACNB1Q02641 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
CACNB1Q02641 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
CACNB1Q02641 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
CACNB1Q02641 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
CACNB1Q02641 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC31.68■■■□□ 2.66
CACNB1Q02641 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.68■■■□□ 2.66
CACNB1Q02641 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.66■■■□□ 2.66
CACNB1Q02641 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CACNB1Q02641 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
CACNB1Q02641 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
CACNB1Q02641 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC31.64■■■□□ 2.66
CACNB1Q02641 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
CACNB1Q02641 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
CACNB1Q02641 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC31.61■■■□□ 2.65
CACNB1Q02641 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
CACNB1Q02641 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
CACNB1Q02641 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CACNB1Q02641 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CACNB1Q02641 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
CACNB1Q02641 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
CACNB1Q02641 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
CACNB1Q02641 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
CACNB1Q02641 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
CACNB1Q02641 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
CACNB1Q02641 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CACNB1Q02641 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
CACNB1Q02641 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CACNB1Q02641 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CACNB1Q02641 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
CACNB1Q02641 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CACNB1Q02641 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CACNB1Q02641 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CACNB1Q02641 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CACNB1Q02641 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CACNB1Q02641 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CACNB1Q02641 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CACNB1Q02641 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
CACNB1Q02641 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CACNB1Q02641 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CACNB1Q02641 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CACNB1Q02641 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC31.34■■■□□ 2.61
CACNB1Q02641 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CACNB1Q02641 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
CACNB1Q02641 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
CACNB1Q02641 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CACNB1Q02641 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CACNB1Q02641 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CACNB1Q02641 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CACNB1Q02641 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CACNB1Q02641 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CACNB1Q02641 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CACNB1Q02641 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CACNB1Q02641 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CACNB1Q02641 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CACNB1Q02641 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CACNB1Q02641 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CACNB1Q02641 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
CACNB1Q02641 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
CACNB1Q02641 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
CACNB1Q02641 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CACNB1Q02641 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
CACNB1Q02641 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
CACNB1Q02641 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CACNB1Q02641 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CACNB1Q02641 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
CACNB1Q02641 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CACNB1Q02641 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.07■■■□□ 2.56
CACNB1Q02641 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
CACNB1Q02641 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
CACNB1Q02641 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CACNB1Q02641 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CACNB1Q02641 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CACNB1Q02641 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 209 ms