Protein–RNA interactions for Protein: P78509

RELN, Reelin, humanhuman

Predictions only

Length 3,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELNP78509 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
RELNP78509 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RELNP78509 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
RELNP78509 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
RELNP78509 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RELNP78509 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RELNP78509 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
RELNP78509 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
RELNP78509 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
RELNP78509 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
RELNP78509 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
RELNP78509 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
RELNP78509 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
RELNP78509 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
RELNP78509 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
RELNP78509 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
RELNP78509 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
RELNP78509 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RELNP78509 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RELNP78509 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
RELNP78509 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
RELNP78509 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RELNP78509 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RELNP78509 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
RELNP78509 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RELNP78509 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RELNP78509 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RELNP78509 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RELNP78509 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RELNP78509 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RELNP78509 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
RELNP78509 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RELNP78509 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
RELNP78509 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RELNP78509 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RELNP78509 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RELNP78509 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RELNP78509 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RELNP78509 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RELNP78509 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RELNP78509 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RELNP78509 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RELNP78509 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RELNP78509 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RELNP78509 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RELNP78509 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RELNP78509 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RELNP78509 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
RELNP78509 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
RELNP78509 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RELNP78509 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
RELNP78509 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RELNP78509 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
RELNP78509 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
RELNP78509 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
RELNP78509 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
RELNP78509 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
RELNP78509 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
RELNP78509 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
RELNP78509 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
RELNP78509 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
RELNP78509 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
RELNP78509 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
RELNP78509 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
RELNP78509 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
RELNP78509 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RELNP78509 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RELNP78509 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RELNP78509 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RELNP78509 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RELNP78509 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RELNP78509 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RELNP78509 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
RELNP78509 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
RELNP78509 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RELNP78509 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RELNP78509 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RELNP78509 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RELNP78509 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
RELNP78509 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
RELNP78509 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
RELNP78509 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
RELNP78509 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
RELNP78509 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
RELNP78509 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
RELNP78509 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
RELNP78509 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RELNP78509 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RELNP78509 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RELNP78509 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RELNP78509 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RELNP78509 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RELNP78509 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RELNP78509 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RELNP78509 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RELNP78509 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RELNP78509 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RELNP78509 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RELNP78509 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RELNP78509 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms