Protein–RNA interactions for Protein: P60412

KRTAP10-11, Keratin-associated protein 10-11, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP10-11P60412 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
KRTAP10-11P60412 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRTAP10-11P60412 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRTAP10-11P60412 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRTAP10-11P60412 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
KRTAP10-11P60412 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRTAP10-11P60412 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KRTAP10-11P60412 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
KRTAP10-11P60412 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
KRTAP10-11P60412 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
KRTAP10-11P60412 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KRTAP10-11P60412 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KRTAP10-11P60412 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KRTAP10-11P60412 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KRTAP10-11P60412 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRTAP10-11P60412 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRTAP10-11P60412 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRTAP10-11P60412 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRTAP10-11P60412 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRTAP10-11P60412 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRTAP10-11P60412 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRTAP10-11P60412 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KRTAP10-11P60412 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KRTAP10-11P60412 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
KRTAP10-11P60412 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
KRTAP10-11P60412 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
KRTAP10-11P60412 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
KRTAP10-11P60412 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRTAP10-11P60412 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRTAP10-11P60412 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRTAP10-11P60412 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRTAP10-11P60412 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRTAP10-11P60412 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KRTAP10-11P60412 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRTAP10-11P60412 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
KRTAP10-11P60412 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
KRTAP10-11P60412 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KRTAP10-11P60412 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KRTAP10-11P60412 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
KRTAP10-11P60412 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
KRTAP10-11P60412 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
KRTAP10-11P60412 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRTAP10-11P60412 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
KRTAP10-11P60412 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRTAP10-11P60412 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
KRTAP10-11P60412 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KRTAP10-11P60412 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
KRTAP10-11P60412 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KRTAP10-11P60412 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KRTAP10-11P60412 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRTAP10-11P60412 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KRTAP10-11P60412 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRTAP10-11P60412 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRTAP10-11P60412 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRTAP10-11P60412 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KRTAP10-11P60412 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
KRTAP10-11P60412 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
KRTAP10-11P60412 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRTAP10-11P60412 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KRTAP10-11P60412 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KRTAP10-11P60412 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KRTAP10-11P60412 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRTAP10-11P60412 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KRTAP10-11P60412 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KRTAP10-11P60412 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KRTAP10-11P60412 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KRTAP10-11P60412 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRTAP10-11P60412 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRTAP10-11P60412 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KRTAP10-11P60412 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRTAP10-11P60412 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
KRTAP10-11P60412 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KRTAP10-11P60412 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KRTAP10-11P60412 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KRTAP10-11P60412 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRTAP10-11P60412 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KRTAP10-11P60412 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KRTAP10-11P60412 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
KRTAP10-11P60412 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KRTAP10-11P60412 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KRTAP10-11P60412 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KRTAP10-11P60412 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KRTAP10-11P60412 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KRTAP10-11P60412 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KRTAP10-11P60412 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KRTAP10-11P60412 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KRTAP10-11P60412 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KRTAP10-11P60412 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KRTAP10-11P60412 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KRTAP10-11P60412 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
KRTAP10-11P60412 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
KRTAP10-11P60412 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KRTAP10-11P60412 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KRTAP10-11P60412 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRTAP10-11P60412 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRTAP10-11P60412 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KRTAP10-11P60412 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
KRTAP10-11P60412 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
KRTAP10-11P60412 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
KRTAP10-11P60412 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms