Protein–RNA interactions for Protein: P60331

KRTAP10-1, Keratin-associated protein 10-1, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP10-1P60331 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KRTAP10-1P60331 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRTAP10-1P60331 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KRTAP10-1P60331 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KRTAP10-1P60331 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
KRTAP10-1P60331 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
KRTAP10-1P60331 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KRTAP10-1P60331 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KRTAP10-1P60331 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
KRTAP10-1P60331 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KRTAP10-1P60331 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KRTAP10-1P60331 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KRTAP10-1P60331 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
KRTAP10-1P60331 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
KRTAP10-1P60331 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
KRTAP10-1P60331 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
KRTAP10-1P60331 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
KRTAP10-1P60331 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
KRTAP10-1P60331 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRTAP10-1P60331 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRTAP10-1P60331 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRTAP10-1P60331 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
KRTAP10-1P60331 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
KRTAP10-1P60331 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
KRTAP10-1P60331 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
KRTAP10-1P60331 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
KRTAP10-1P60331 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
KRTAP10-1P60331 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
KRTAP10-1P60331 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
KRTAP10-1P60331 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
KRTAP10-1P60331 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KRTAP10-1P60331 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
KRTAP10-1P60331 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
KRTAP10-1P60331 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
KRTAP10-1P60331 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
KRTAP10-1P60331 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
KRTAP10-1P60331 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
KRTAP10-1P60331 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
KRTAP10-1P60331 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
KRTAP10-1P60331 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
KRTAP10-1P60331 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
KRTAP10-1P60331 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
KRTAP10-1P60331 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
KRTAP10-1P60331 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
KRTAP10-1P60331 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KRTAP10-1P60331 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KRTAP10-1P60331 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRTAP10-1P60331 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRTAP10-1P60331 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KRTAP10-1P60331 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
KRTAP10-1P60331 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
KRTAP10-1P60331 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
KRTAP10-1P60331 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
KRTAP10-1P60331 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRTAP10-1P60331 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
KRTAP10-1P60331 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
KRTAP10-1P60331 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KRTAP10-1P60331 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
KRTAP10-1P60331 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KRTAP10-1P60331 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KRTAP10-1P60331 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRTAP10-1P60331 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KRTAP10-1P60331 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KRTAP10-1P60331 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KRTAP10-1P60331 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KRTAP10-1P60331 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRTAP10-1P60331 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KRTAP10-1P60331 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KRTAP10-1P60331 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
KRTAP10-1P60331 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRTAP10-1P60331 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRTAP10-1P60331 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRTAP10-1P60331 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
KRTAP10-1P60331 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
KRTAP10-1P60331 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRTAP10-1P60331 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
KRTAP10-1P60331 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
KRTAP10-1P60331 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
KRTAP10-1P60331 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
KRTAP10-1P60331 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
KRTAP10-1P60331 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KRTAP10-1P60331 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KRTAP10-1P60331 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRTAP10-1P60331 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRTAP10-1P60331 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KRTAP10-1P60331 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KRTAP10-1P60331 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KRTAP10-1P60331 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
KRTAP10-1P60331 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
KRTAP10-1P60331 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
KRTAP10-1P60331 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
KRTAP10-1P60331 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
KRTAP10-1P60331 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRTAP10-1P60331 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
KRTAP10-1P60331 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
KRTAP10-1P60331 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
KRTAP10-1P60331 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRTAP10-1P60331 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
KRTAP10-1P60331 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
KRTAP10-1P60331 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms