Protein–RNA interactions for Protein: P58294

PROK1, Prokineticin-1, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROK1P58294 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PROK1P58294 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PROK1P58294 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PROK1P58294 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PROK1P58294 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PROK1P58294 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PROK1P58294 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PROK1P58294 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
PROK1P58294 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PROK1P58294 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PROK1P58294 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PROK1P58294 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PROK1P58294 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PROK1P58294 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PROK1P58294 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PROK1P58294 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PROK1P58294 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PROK1P58294 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PROK1P58294 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PROK1P58294 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PROK1P58294 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PROK1P58294 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PROK1P58294 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PROK1P58294 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PROK1P58294 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PROK1P58294 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PROK1P58294 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PROK1P58294 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PROK1P58294 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PROK1P58294 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PROK1P58294 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PROK1P58294 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PROK1P58294 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PROK1P58294 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PROK1P58294 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PROK1P58294 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PROK1P58294 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PROK1P58294 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PROK1P58294 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PROK1P58294 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PROK1P58294 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PROK1P58294 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PROK1P58294 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PROK1P58294 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PROK1P58294 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PROK1P58294 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PROK1P58294 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PROK1P58294 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PROK1P58294 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PROK1P58294 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PROK1P58294 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PROK1P58294 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
PROK1P58294 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PROK1P58294 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PROK1P58294 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PROK1P58294 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PROK1P58294 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PROK1P58294 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PROK1P58294 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PROK1P58294 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PROK1P58294 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PROK1P58294 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PROK1P58294 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PROK1P58294 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PROK1P58294 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PROK1P58294 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PROK1P58294 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PROK1P58294 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PROK1P58294 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PROK1P58294 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PROK1P58294 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PROK1P58294 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PROK1P58294 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PROK1P58294 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PROK1P58294 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PROK1P58294 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PROK1P58294 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PROK1P58294 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PROK1P58294 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PROK1P58294 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PROK1P58294 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PROK1P58294 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PROK1P58294 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PROK1P58294 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PROK1P58294 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PROK1P58294 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PROK1P58294 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PROK1P58294 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PROK1P58294 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PROK1P58294 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PROK1P58294 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PROK1P58294 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PROK1P58294 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PROK1P58294 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PROK1P58294 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PROK1P58294 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PROK1P58294 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PROK1P58294 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PROK1P58294 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PROK1P58294 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms