Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.65■■■■□ 3.62
CASP5P51878 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
CASP5P51878 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.76■■■■□ 3.48
CASP5P51878 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CASP5P51878 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
CASP5P51878 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
CASP5P51878 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
CASP5P51878 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
CASP5P51878 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
CASP5P51878 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC35.89■■■■□ 3.34
CASP5P51878 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
CASP5P51878 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
CASP5P51878 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
CASP5P51878 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CASP5P51878 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
CASP5P51878 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.92■■■■□ 3.18
CASP5P51878 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
CASP5P51878 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
CASP5P51878 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
CASP5P51878 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
CASP5P51878 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
CASP5P51878 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CASP5P51878 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CASP5P51878 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
CASP5P51878 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CASP5P51878 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CASP5P51878 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CASP5P51878 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CASP5P51878 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
CASP5P51878 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
CASP5P51878 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
CASP5P51878 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
CASP5P51878 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
CASP5P51878 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
CASP5P51878 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
CASP5P51878 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.66■■■□□ 2.98
CASP5P51878 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
CASP5P51878 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
CASP5P51878 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CASP5P51878 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CASP5P51878 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CASP5P51878 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CASP5P51878 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
CASP5P51878 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
CASP5P51878 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
CASP5P51878 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
CASP5P51878 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
CASP5P51878 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
CASP5P51878 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
CASP5P51878 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CASP5P51878 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CASP5P51878 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CASP5P51878 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CASP5P51878 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CASP5P51878 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
CASP5P51878 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CASP5P51878 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
CASP5P51878 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
CASP5P51878 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.84■■■□□ 2.85
CASP5P51878 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
CASP5P51878 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
CASP5P51878 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
CASP5P51878 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.84
CASP5P51878 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
CASP5P51878 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CASP5P51878 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
CASP5P51878 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
CASP5P51878 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CASP5P51878 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
CASP5P51878 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
CASP5P51878 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CASP5P51878 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CASP5P51878 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CASP5P51878 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CASP5P51878 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CASP5P51878 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CASP5P51878 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CASP5P51878 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CASP5P51878 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CASP5P51878 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CASP5P51878 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CASP5P51878 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CASP5P51878 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
CASP5P51878 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
CASP5P51878 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CASP5P51878 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CASP5P51878 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CASP5P51878 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CASP5P51878 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CASP5P51878 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CASP5P51878 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CASP5P51878 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
CASP5P51878 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
CASP5P51878 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CASP5P51878 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CASP5P51878 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CASP5P51878 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CASP5P51878 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CASP5P51878 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CASP5P51878 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms