Protein–RNA interactions for Protein: P51149

RAB7A, Ras-related protein Rab-7a, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB7AP51149 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
RAB7AP51149 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
RAB7AP51149 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RAB7AP51149 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
RAB7AP51149 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
RAB7AP51149 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
RAB7AP51149 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RAB7AP51149 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RAB7AP51149 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAB7AP51149 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAB7AP51149 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
RAB7AP51149 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
RAB7AP51149 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
RAB7AP51149 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RAB7AP51149 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RAB7AP51149 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RAB7AP51149 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RAB7AP51149 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB7AP51149 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB7AP51149 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB7AP51149 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB7AP51149 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB7AP51149 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB7AP51149 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RAB7AP51149 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RAB7AP51149 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RAB7AP51149 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RAB7AP51149 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RAB7AP51149 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RAB7AP51149 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RAB7AP51149 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB7AP51149 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RAB7AP51149 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RAB7AP51149 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RAB7AP51149 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAB7AP51149 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAB7AP51149 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB7AP51149 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAB7AP51149 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
RAB7AP51149 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAB7AP51149 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RAB7AP51149 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RAB7AP51149 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAB7AP51149 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAB7AP51149 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAB7AP51149 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB7AP51149 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB7AP51149 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB7AP51149 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAB7AP51149 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
RAB7AP51149 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAB7AP51149 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB7AP51149 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAB7AP51149 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAB7AP51149 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAB7AP51149 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAB7AP51149 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAB7AP51149 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB7AP51149 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAB7AP51149 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RAB7AP51149 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAB7AP51149 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB7AP51149 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAB7AP51149 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAB7AP51149 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAB7AP51149 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
RAB7AP51149 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB7AP51149 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB7AP51149 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB7AP51149 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB7AP51149 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB7AP51149 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RAB7AP51149 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RAB7AP51149 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RAB7AP51149 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RAB7AP51149 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RAB7AP51149 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RAB7AP51149 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB7AP51149 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RAB7AP51149 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RAB7AP51149 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB7AP51149 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB7AP51149 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RAB7AP51149 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RAB7AP51149 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RAB7AP51149 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB7AP51149 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB7AP51149 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RAB7AP51149 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB7AP51149 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RAB7AP51149 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB7AP51149 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB7AP51149 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
RAB7AP51149 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
RAB7AP51149 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB7AP51149 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
RAB7AP51149 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB7AP51149 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
RAB7AP51149 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RAB7AP51149 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms