Protein–RNA interactions for Protein: P46940

IQGAP1, Ras GTPase-activating-like protein IQGAP1, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQGAP1P46940 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC43.02■■■■■ 4.48
IQGAP1P46940 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC43.01■■■■■ 4.48
IQGAP1P46940 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
IQGAP1P46940 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
IQGAP1P46940 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
IQGAP1P46940 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC42.97■■■■■ 4.47
IQGAP1P46940 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC42.97■■■■■ 4.47
IQGAP1P46940 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
IQGAP1P46940 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
IQGAP1P46940 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
IQGAP1P46940 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC42.83■■■■■ 4.45
IQGAP1P46940 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC42.79■■■■■ 4.44
IQGAP1P46940 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.79■■■■■ 4.44
IQGAP1P46940 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
IQGAP1P46940 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC42.77■■■■■ 4.44
IQGAP1P46940 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.7■■■■■ 4.43
IQGAP1P46940 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC42.61■■■■■ 4.41
IQGAP1P46940 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
IQGAP1P46940 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC42.57■■■■■ 4.41
IQGAP1P46940 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC42.51■■■■■ 4.4
IQGAP1P46940 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC42.47■■■■■ 4.39
IQGAP1P46940 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC42.41■■■■■ 4.38
IQGAP1P46940 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC42.41■■■■■ 4.38
IQGAP1P46940 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC42.4■■■■■ 4.38
IQGAP1P46940 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.39■■■■■ 4.38
IQGAP1P46940 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.36■■■■■ 4.37
IQGAP1P46940 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.36■■■■■ 4.37
IQGAP1P46940 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.35■■■■■ 4.37
IQGAP1P46940 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC42.28■■■■■ 4.36
IQGAP1P46940 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
IQGAP1P46940 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
IQGAP1P46940 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC42.21■■■■■ 4.35
IQGAP1P46940 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.35
IQGAP1P46940 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
IQGAP1P46940 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC42.17■■■■■ 4.34
IQGAP1P46940 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
IQGAP1P46940 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC42.1■■■■■ 4.33
IQGAP1P46940 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.08■■■■■ 4.33
IQGAP1P46940 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC42.08■■■■■ 4.33
IQGAP1P46940 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC42.06■■■■■ 4.32
IQGAP1P46940 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
IQGAP1P46940 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC42.06■■■■■ 4.32
IQGAP1P46940 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
IQGAP1P46940 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC42.01■■■■■ 4.32
IQGAP1P46940 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC42■■■■■ 4.31
IQGAP1P46940 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
IQGAP1P46940 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
IQGAP1P46940 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
IQGAP1P46940 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.97■■■■■ 4.31
IQGAP1P46940 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
IQGAP1P46940 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC41.92■■■■■ 4.3
IQGAP1P46940 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC41.87■■■■■ 4.29
IQGAP1P46940 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
IQGAP1P46940 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC41.85■■■■■ 4.29
IQGAP1P46940 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC41.82■■■■■ 4.29
IQGAP1P46940 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC41.81■■■■■ 4.28
IQGAP1P46940 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
IQGAP1P46940 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC41.76■■■■■ 4.28
IQGAP1P46940 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
IQGAP1P46940 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
IQGAP1P46940 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC41.67■■■■■ 4.26
IQGAP1P46940 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC41.67■■■■■ 4.26
IQGAP1P46940 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC41.63■■■■■ 4.25
IQGAP1P46940 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.63■■■■■ 4.25
IQGAP1P46940 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC41.61■■■■■ 4.25
IQGAP1P46940 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.61■■■■■ 4.25
IQGAP1P46940 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC41.58■■■■■ 4.25
IQGAP1P46940 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC41.57■■■■■ 4.25
IQGAP1P46940 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.5■■■■■ 4.23
IQGAP1P46940 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
IQGAP1P46940 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC41.47■■■■■ 4.23
IQGAP1P46940 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.44■■■■■ 4.22
IQGAP1P46940 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC41.44■■■■■ 4.22
IQGAP1P46940 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.43■■■■■ 4.22
IQGAP1P46940 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
IQGAP1P46940 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
IQGAP1P46940 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.42■■■■■ 4.22
IQGAP1P46940 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC41.41■■■■■ 4.22
IQGAP1P46940 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC41.39■■■■■ 4.22
IQGAP1P46940 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.39■■■■■ 4.22
IQGAP1P46940 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.38■■■■■ 4.21
IQGAP1P46940 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
IQGAP1P46940 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
IQGAP1P46940 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.31■■■■■ 4.2
IQGAP1P46940 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC41.29■■■■■ 4.2
IQGAP1P46940 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.28■■■■■ 4.2
IQGAP1P46940 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.27■■■■■ 4.2
IQGAP1P46940 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC41.24■■■■■ 4.19
IQGAP1P46940 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC41.24■■■■■ 4.19
IQGAP1P46940 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
IQGAP1P46940 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC41.17■■■■■ 4.18
IQGAP1P46940 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
IQGAP1P46940 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.16■■■■■ 4.18
IQGAP1P46940 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
IQGAP1P46940 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC41.13■■■■■ 4.17
IQGAP1P46940 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
IQGAP1P46940 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
IQGAP1P46940 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC41.1■■■■■ 4.17
IQGAP1P46940 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC41.08■■■■■ 4.17
IQGAP1P46940 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms