Protein–RNA interactions for Protein: P35749

MYH11, Myosin-11, humanhuman

Predictions only

Length 1,972 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH11P35749 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC37.77■■■■□ 3.64
MYH11P35749 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
MYH11P35749 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC36.93■■■■□ 3.5
MYH11P35749 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
MYH11P35749 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
MYH11P35749 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
MYH11P35749 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
MYH11P35749 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
MYH11P35749 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
MYH11P35749 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC36.02■■■■□ 3.36
MYH11P35749 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
MYH11P35749 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC35.74■■■■□ 3.31
MYH11P35749 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.67■■■■□ 3.3
MYH11P35749 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
MYH11P35749 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
MYH11P35749 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
MYH11P35749 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC34.99■■■■□ 3.19
MYH11P35749 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.92■■■■□ 3.18
MYH11P35749 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
MYH11P35749 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
MYH11P35749 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
MYH11P35749 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
MYH11P35749 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.64■■■■□ 3.14
MYH11P35749 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
MYH11P35749 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
MYH11P35749 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
MYH11P35749 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
MYH11P35749 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
MYH11P35749 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
MYH11P35749 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
MYH11P35749 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
MYH11P35749 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
MYH11P35749 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
MYH11P35749 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
MYH11P35749 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
MYH11P35749 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
MYH11P35749 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
MYH11P35749 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
MYH11P35749 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
MYH11P35749 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
MYH11P35749 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
MYH11P35749 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
MYH11P35749 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
MYH11P35749 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
MYH11P35749 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
MYH11P35749 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
MYH11P35749 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
MYH11P35749 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
MYH11P35749 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
MYH11P35749 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
MYH11P35749 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
MYH11P35749 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
MYH11P35749 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
MYH11P35749 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
MYH11P35749 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
MYH11P35749 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
MYH11P35749 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
MYH11P35749 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
MYH11P35749 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.89■■■□□ 2.86
MYH11P35749 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC32.85■■■□□ 2.85
MYH11P35749 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
MYH11P35749 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
MYH11P35749 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
MYH11P35749 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
MYH11P35749 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
MYH11P35749 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
MYH11P35749 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
MYH11P35749 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
MYH11P35749 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
MYH11P35749 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
MYH11P35749 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.81
MYH11P35749 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
MYH11P35749 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
MYH11P35749 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
MYH11P35749 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
MYH11P35749 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC32.46■■■□□ 2.79
MYH11P35749 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
MYH11P35749 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
MYH11P35749 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
MYH11P35749 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
MYH11P35749 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
MYH11P35749 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
MYH11P35749 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
MYH11P35749 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
MYH11P35749 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
MYH11P35749 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
MYH11P35749 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
MYH11P35749 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
MYH11P35749 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
MYH11P35749 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
MYH11P35749 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
MYH11P35749 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
MYH11P35749 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
MYH11P35749 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
MYH11P35749 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
MYH11P35749 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
MYH11P35749 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
MYH11P35749 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
MYH11P35749 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
MYH11P35749 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms