Protein–RNA interactions for Protein: P30626

SRI, Sorcin, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRIP30626 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SRIP30626 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SRIP30626 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRIP30626 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRIP30626 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SRIP30626 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRIP30626 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SRIP30626 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SRIP30626 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SRIP30626 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SRIP30626 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SRIP30626 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SRIP30626 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SRIP30626 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SRIP30626 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SRIP30626 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SRIP30626 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SRIP30626 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SRIP30626 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SRIP30626 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SRIP30626 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SRIP30626 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SRIP30626 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SRIP30626 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SRIP30626 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SRIP30626 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRIP30626 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SRIP30626 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SRIP30626 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SRIP30626 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SRIP30626 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SRIP30626 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SRIP30626 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SRIP30626 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SRIP30626 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SRIP30626 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SRIP30626 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SRIP30626 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SRIP30626 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SRIP30626 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SRIP30626 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SRIP30626 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SRIP30626 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SRIP30626 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SRIP30626 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SRIP30626 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SRIP30626 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRIP30626 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SRIP30626 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRIP30626 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SRIP30626 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SRIP30626 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SRIP30626 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SRIP30626 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SRIP30626 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRIP30626 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRIP30626 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRIP30626 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRIP30626 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRIP30626 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRIP30626 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRIP30626 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SRIP30626 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SRIP30626 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SRIP30626 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SRIP30626 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SRIP30626 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRIP30626 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SRIP30626 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SRIP30626 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SRIP30626 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SRIP30626 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SRIP30626 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SRIP30626 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SRIP30626 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRIP30626 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SRIP30626 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SRIP30626 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRIP30626 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SRIP30626 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRIP30626 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SRIP30626 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRIP30626 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SRIP30626 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRIP30626 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRIP30626 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRIP30626 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SRIP30626 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SRIP30626 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRIP30626 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SRIP30626 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SRIP30626 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRIP30626 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SRIP30626 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SRIP30626 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRIP30626 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SRIP30626 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SRIP30626 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRIP30626 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SRIP30626 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms