Protein–RNA interactions for Protein: P25787

PSMA2, Proteasome subunit alpha type-2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA2P25787 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC35.53■■■■□ 3.28
PSMA2P25787 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
PSMA2P25787 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
PSMA2P25787 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
PSMA2P25787 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
PSMA2P25787 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PSMA2P25787 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
PSMA2P25787 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
PSMA2P25787 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
PSMA2P25787 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
PSMA2P25787 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
PSMA2P25787 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
PSMA2P25787 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PSMA2P25787 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PSMA2P25787 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
PSMA2P25787 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
PSMA2P25787 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
PSMA2P25787 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.9■■■□□ 2.86
PSMA2P25787 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
PSMA2P25787 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
PSMA2P25787 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
PSMA2P25787 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PSMA2P25787 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PSMA2P25787 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
PSMA2P25787 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
PSMA2P25787 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
PSMA2P25787 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PSMA2P25787 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PSMA2P25787 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PSMA2P25787 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PSMA2P25787 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
PSMA2P25787 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PSMA2P25787 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PSMA2P25787 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
PSMA2P25787 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PSMA2P25787 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
PSMA2P25787 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
PSMA2P25787 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
PSMA2P25787 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.95■■■□□ 2.7
PSMA2P25787 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
PSMA2P25787 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
PSMA2P25787 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
PSMA2P25787 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
PSMA2P25787 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
PSMA2P25787 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
PSMA2P25787 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
PSMA2P25787 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PSMA2P25787 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
PSMA2P25787 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
PSMA2P25787 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
PSMA2P25787 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
PSMA2P25787 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
PSMA2P25787 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
PSMA2P25787 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PSMA2P25787 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PSMA2P25787 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
PSMA2P25787 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
PSMA2P25787 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
PSMA2P25787 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PSMA2P25787 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
PSMA2P25787 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
PSMA2P25787 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
PSMA2P25787 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PSMA2P25787 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PSMA2P25787 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PSMA2P25787 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
PSMA2P25787 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PSMA2P25787 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PSMA2P25787 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PSMA2P25787 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
PSMA2P25787 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PSMA2P25787 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PSMA2P25787 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PSMA2P25787 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PSMA2P25787 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PSMA2P25787 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.52
PSMA2P25787 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC30.72■■■□□ 2.51
PSMA2P25787 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PSMA2P25787 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PSMA2P25787 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
PSMA2P25787 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
PSMA2P25787 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
PSMA2P25787 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
PSMA2P25787 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
PSMA2P25787 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
PSMA2P25787 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
PSMA2P25787 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PSMA2P25787 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PSMA2P25787 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PSMA2P25787 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PSMA2P25787 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PSMA2P25787 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PSMA2P25787 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PSMA2P25787 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC30.29■■■□□ 2.44
PSMA2P25787 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.44
PSMA2P25787 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
PSMA2P25787 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
PSMA2P25787 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
PSMA2P25787 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
PSMA2P25787 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms