Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
RAB4AP20338 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RAB4AP20338 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RAB4AP20338 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RAB4AP20338 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAB4AP20338 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RAB4AP20338 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAB4AP20338 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAB4AP20338 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAB4AP20338 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB4AP20338 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB4AP20338 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB4AP20338 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RAB4AP20338 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RAB4AP20338 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RAB4AP20338 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RAB4AP20338 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RAB4AP20338 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RAB4AP20338 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
RAB4AP20338 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
RAB4AP20338 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RAB4AP20338 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RAB4AP20338 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
RAB4AP20338 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RAB4AP20338 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB4AP20338 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RAB4AP20338 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB4AP20338 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
RAB4AP20338 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB4AP20338 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB4AP20338 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB4AP20338 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RAB4AP20338 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RAB4AP20338 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB4AP20338 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RAB4AP20338 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RAB4AP20338 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB4AP20338 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RAB4AP20338 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RAB4AP20338 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RAB4AP20338 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB4AP20338 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RAB4AP20338 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB4AP20338 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAB4AP20338 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RAB4AP20338 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAB4AP20338 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB4AP20338 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB4AP20338 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAB4AP20338 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB4AP20338 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB4AP20338 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB4AP20338 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB4AP20338 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB4AP20338 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB4AP20338 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB4AP20338 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB4AP20338 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB4AP20338 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB4AP20338 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB4AP20338 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB4AP20338 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB4AP20338 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RAB4AP20338 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB4AP20338 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RAB4AP20338 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RAB4AP20338 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RAB4AP20338 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RAB4AP20338 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RAB4AP20338 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RAB4AP20338 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RAB4AP20338 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RAB4AP20338 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB4AP20338 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB4AP20338 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RAB4AP20338 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RAB4AP20338 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RAB4AP20338 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB4AP20338 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
RAB4AP20338 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RAB4AP20338 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RAB4AP20338 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RAB4AP20338 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RAB4AP20338 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB4AP20338 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RAB4AP20338 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB4AP20338 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RAB4AP20338 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RAB4AP20338 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RAB4AP20338 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RAB4AP20338 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RAB4AP20338 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB4AP20338 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
RAB4AP20338 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RAB4AP20338 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB4AP20338 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB4AP20338 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RAB4AP20338 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RAB4AP20338 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RAB4AP20338 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms